Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

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Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Pdzd2E9Q1M1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pdzd2E9Q1M1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pdzd2E9Q1M1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pdzd2E9Q1M1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pdzd2E9Q1M1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pdzd2E9Q1M1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pdzd2E9Q1M1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pdzd2E9Q1M1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pdzd2E9Q1M1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pdzd2E9Q1M1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pdzd2E9Q1M1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pdzd2E9Q1M1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdzd2E9Q1M1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdzd2E9Q1M1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdzd2E9Q1M1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdzd2E9Q1M1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdzd2E9Q1M1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdzd2E9Q1M1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdzd2E9Q1M1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdzd2E9Q1M1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdzd2E9Q1M1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdzd2E9Q1M1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdzd2E9Q1M1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdzd2E9Q1M1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdzd2E9Q1M1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdzd2E9Q1M1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdzd2E9Q1M1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdzd2E9Q1M1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdzd2E9Q1M1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdzd2E9Q1M1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdzd2E9Q1M1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdzd2E9Q1M1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pdzd2E9Q1M1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdzd2E9Q1M1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdzd2E9Q1M1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdzd2E9Q1M1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdzd2E9Q1M1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdzd2E9Q1M1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdzd2E9Q1M1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdzd2E9Q1M1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdzd2E9Q1M1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdzd2E9Q1M1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdzd2E9Q1M1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdzd2E9Q1M1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdzd2E9Q1M1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdzd2E9Q1M1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdzd2E9Q1M1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdzd2E9Q1M1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdzd2E9Q1M1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdzd2E9Q1M1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdzd2E9Q1M1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdzd2E9Q1M1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdzd2E9Q1M1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdzd2E9Q1M1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdzd2E9Q1M1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdzd2E9Q1M1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdzd2E9Q1M1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdzd2E9Q1M1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdzd2E9Q1M1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdzd2E9Q1M1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdzd2E9Q1M1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdzd2E9Q1M1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdzd2E9Q1M1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdzd2E9Q1M1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdzd2E9Q1M1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdzd2E9Q1M1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdzd2E9Q1M1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdzd2E9Q1M1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdzd2E9Q1M1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdzd2E9Q1M1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdzd2E9Q1M1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdzd2E9Q1M1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdzd2E9Q1M1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdzd2E9Q1M1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdzd2E9Q1M1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdzd2E9Q1M1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdzd2E9Q1M1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdzd2E9Q1M1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdzd2E9Q1M1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdzd2E9Q1M1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdzd2E9Q1M1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdzd2E9Q1M1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdzd2E9Q1M1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdzd2E9Q1M1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdzd2E9Q1M1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdzd2E9Q1M1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdzd2E9Q1M1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdzd2E9Q1M1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pdzd2E9Q1M1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pdzd2E9Q1M1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pdzd2E9Q1M1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pdzd2E9Q1M1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pdzd2E9Q1M1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdzd2E9Q1M1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdzd2E9Q1M1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdzd2E9Q1M1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdzd2E9Q1M1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdzd2E9Q1M1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdzd2E9Q1M1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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