Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zfp558E9Q1J0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zfp558E9Q1J0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zfp558E9Q1J0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Zfp558E9Q1J0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Zfp558E9Q1J0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Zfp558E9Q1J0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zfp558E9Q1J0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zfp558E9Q1J0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zfp558E9Q1J0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zfp558E9Q1J0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zfp558E9Q1J0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zfp558E9Q1J0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zfp558E9Q1J0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zfp558E9Q1J0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zfp558E9Q1J0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zfp558E9Q1J0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zfp558E9Q1J0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zfp558E9Q1J0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zfp558E9Q1J0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zfp558E9Q1J0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zfp558E9Q1J0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zfp558E9Q1J0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zfp558E9Q1J0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zfp558E9Q1J0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zfp558E9Q1J0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zfp558E9Q1J0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zfp558E9Q1J0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zfp558E9Q1J0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zfp558E9Q1J0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zfp558E9Q1J0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zfp558E9Q1J0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zfp558E9Q1J0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zfp558E9Q1J0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zfp558E9Q1J0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Zfp558E9Q1J0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zfp558E9Q1J0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zfp558E9Q1J0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zfp558E9Q1J0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Zfp558E9Q1J0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zfp558E9Q1J0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zfp558E9Q1J0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zfp558E9Q1J0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zfp558E9Q1J0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zfp558E9Q1J0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zfp558E9Q1J0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zfp558E9Q1J0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zfp558E9Q1J0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zfp558E9Q1J0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zfp558E9Q1J0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zfp558E9Q1J0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zfp558E9Q1J0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zfp558E9Q1J0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zfp558E9Q1J0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zfp558E9Q1J0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zfp558E9Q1J0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zfp558E9Q1J0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zfp558E9Q1J0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zfp558E9Q1J0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zfp558E9Q1J0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Zfp558E9Q1J0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zfp558E9Q1J0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zfp558E9Q1J0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zfp558E9Q1J0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zfp558E9Q1J0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zfp558E9Q1J0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zfp558E9Q1J0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zfp558E9Q1J0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zfp558E9Q1J0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zfp558E9Q1J0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zfp558E9Q1J0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zfp558E9Q1J0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zfp558E9Q1J0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zfp558E9Q1J0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zfp558E9Q1J0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zfp558E9Q1J0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Zfp558E9Q1J0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Zfp558E9Q1J0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zfp558E9Q1J0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zfp558E9Q1J0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zfp558E9Q1J0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zfp558E9Q1J0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zfp558E9Q1J0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zfp558E9Q1J0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zfp558E9Q1J0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zfp558E9Q1J0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zfp558E9Q1J0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zfp558E9Q1J0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zfp558E9Q1J0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zfp558E9Q1J0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zfp558E9Q1J0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zfp558E9Q1J0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zfp558E9Q1J0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zfp558E9Q1J0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zfp558E9Q1J0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zfp558E9Q1J0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zfp558E9Q1J0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zfp558E9Q1J0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zfp558E9Q1J0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zfp558E9Q1J0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
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