Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0B4

Cdr1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr1E9Q0B4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdr1E9Q0B4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdr1E9Q0B4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdr1E9Q0B4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdr1E9Q0B4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdr1E9Q0B4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdr1E9Q0B4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdr1E9Q0B4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdr1E9Q0B4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdr1E9Q0B4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdr1E9Q0B4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdr1E9Q0B4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cdr1E9Q0B4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdr1E9Q0B4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdr1E9Q0B4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdr1E9Q0B4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdr1E9Q0B4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdr1E9Q0B4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdr1E9Q0B4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdr1E9Q0B4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdr1E9Q0B4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdr1E9Q0B4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdr1E9Q0B4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdr1E9Q0B4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdr1E9Q0B4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdr1E9Q0B4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdr1E9Q0B4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdr1E9Q0B4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdr1E9Q0B4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdr1E9Q0B4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdr1E9Q0B4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdr1E9Q0B4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdr1E9Q0B4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdr1E9Q0B4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdr1E9Q0B4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdr1E9Q0B4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdr1E9Q0B4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdr1E9Q0B4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdr1E9Q0B4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdr1E9Q0B4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdr1E9Q0B4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdr1E9Q0B4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdr1E9Q0B4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Cdr1E9Q0B4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cdr1E9Q0B4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cdr1E9Q0B4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdr1E9Q0B4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdr1E9Q0B4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdr1E9Q0B4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdr1E9Q0B4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdr1E9Q0B4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdr1E9Q0B4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdr1E9Q0B4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdr1E9Q0B4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdr1E9Q0B4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdr1E9Q0B4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdr1E9Q0B4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdr1E9Q0B4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdr1E9Q0B4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdr1E9Q0B4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdr1E9Q0B4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdr1E9Q0B4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdr1E9Q0B4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdr1E9Q0B4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdr1E9Q0B4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdr1E9Q0B4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdr1E9Q0B4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdr1E9Q0B4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdr1E9Q0B4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdr1E9Q0B4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdr1E9Q0B4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdr1E9Q0B4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdr1E9Q0B4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdr1E9Q0B4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cdr1E9Q0B4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdr1E9Q0B4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdr1E9Q0B4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdr1E9Q0B4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdr1E9Q0B4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdr1E9Q0B4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdr1E9Q0B4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdr1E9Q0B4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdr1E9Q0B4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdr1E9Q0B4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdr1E9Q0B4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdr1E9Q0B4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdr1E9Q0B4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdr1E9Q0B4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdr1E9Q0B4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdr1E9Q0B4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdr1E9Q0B4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdr1E9Q0B4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdr1E9Q0B4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdr1E9Q0B4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdr1E9Q0B4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdr1E9Q0B4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdr1E9Q0B4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdr1E9Q0B4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdr1E9Q0B4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdr1E9Q0B4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms