Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM7

Scaf11, SR-related CTD-associated factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf11E9PZM7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Scaf11E9PZM7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Scaf11E9PZM7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Scaf11E9PZM7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
Scaf11E9PZM7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Scaf11E9PZM7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Scaf11E9PZM7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Scaf11E9PZM7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Scaf11E9PZM7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Scaf11E9PZM7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Scaf11E9PZM7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Scaf11E9PZM7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Scaf11E9PZM7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Scaf11E9PZM7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Scaf11E9PZM7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Scaf11E9PZM7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
Scaf11E9PZM7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Scaf11E9PZM7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Scaf11E9PZM7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Scaf11E9PZM7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Scaf11E9PZM7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Scaf11E9PZM7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Scaf11E9PZM7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
Scaf11E9PZM7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Scaf11E9PZM7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Scaf11E9PZM7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Scaf11E9PZM7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Scaf11E9PZM7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Scaf11E9PZM7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Scaf11E9PZM7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
Scaf11E9PZM7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC32.76■■■□□ 2.84
Scaf11E9PZM7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Scaf11E9PZM7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Scaf11E9PZM7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Scaf11E9PZM7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Scaf11E9PZM7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
Scaf11E9PZM7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Scaf11E9PZM7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Scaf11E9PZM7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Scaf11E9PZM7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
Scaf11E9PZM7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Scaf11E9PZM7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Scaf11E9PZM7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Scaf11E9PZM7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Scaf11E9PZM7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Scaf11E9PZM7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Scaf11E9PZM7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Scaf11E9PZM7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Scaf11E9PZM7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Scaf11E9PZM7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Scaf11E9PZM7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Scaf11E9PZM7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Scaf11E9PZM7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Scaf11E9PZM7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Scaf11E9PZM7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Scaf11E9PZM7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Scaf11E9PZM7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Scaf11E9PZM7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Scaf11E9PZM7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Scaf11E9PZM7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Scaf11E9PZM7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Scaf11E9PZM7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Scaf11E9PZM7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Scaf11E9PZM7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Scaf11E9PZM7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Scaf11E9PZM7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Scaf11E9PZM7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
Scaf11E9PZM7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
Scaf11E9PZM7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Scaf11E9PZM7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Scaf11E9PZM7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Scaf11E9PZM7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Scaf11E9PZM7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Scaf11E9PZM7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Scaf11E9PZM7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Scaf11E9PZM7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Scaf11E9PZM7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Scaf11E9PZM7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Scaf11E9PZM7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Scaf11E9PZM7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Scaf11E9PZM7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Scaf11E9PZM7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Scaf11E9PZM7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
Scaf11E9PZM7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Scaf11E9PZM7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
Scaf11E9PZM7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
Scaf11E9PZM7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Scaf11E9PZM7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Scaf11E9PZM7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Scaf11E9PZM7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Scaf11E9PZM7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Scaf11E9PZM7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Scaf11E9PZM7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Scaf11E9PZM7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Scaf11E9PZM7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Scaf11E9PZM7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Scaf11E9PZM7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Scaf11E9PZM7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Scaf11E9PZM7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Scaf11E9PZM7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms