Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Brd1E9PZ26 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Brd1E9PZ26 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Brd1E9PZ26 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Brd1E9PZ26 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Brd1E9PZ26 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Brd1E9PZ26 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Brd1E9PZ26 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Brd1E9PZ26 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Brd1E9PZ26 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Brd1E9PZ26 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Brd1E9PZ26 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Brd1E9PZ26 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Brd1E9PZ26 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Brd1E9PZ26 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Brd1E9PZ26 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Brd1E9PZ26 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Brd1E9PZ26 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Brd1E9PZ26 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Brd1E9PZ26 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Brd1E9PZ26 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Brd1E9PZ26 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Brd1E9PZ26 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Brd1E9PZ26 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Brd1E9PZ26 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Brd1E9PZ26 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Brd1E9PZ26 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Brd1E9PZ26 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Brd1E9PZ26 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Brd1E9PZ26 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Brd1E9PZ26 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Brd1E9PZ26 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Brd1E9PZ26 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Brd1E9PZ26 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Brd1E9PZ26 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Brd1E9PZ26 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Brd1E9PZ26 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Brd1E9PZ26 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Brd1E9PZ26 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Brd1E9PZ26 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Brd1E9PZ26 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Brd1E9PZ26 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Brd1E9PZ26 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Brd1E9PZ26 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Brd1E9PZ26 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Brd1E9PZ26 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Brd1E9PZ26 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Brd1E9PZ26 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Brd1E9PZ26 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Brd1E9PZ26 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Brd1E9PZ26 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Brd1E9PZ26 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Brd1E9PZ26 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Brd1E9PZ26 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Brd1E9PZ26 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Brd1E9PZ26 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Brd1E9PZ26 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Brd1E9PZ26 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Brd1E9PZ26 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Brd1E9PZ26 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Brd1E9PZ26 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Brd1E9PZ26 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Brd1E9PZ26 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Brd1E9PZ26 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Brd1E9PZ26 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Brd1E9PZ26 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Brd1E9PZ26 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Brd1E9PZ26 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Brd1E9PZ26 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Brd1E9PZ26 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Brd1E9PZ26 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Brd1E9PZ26 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Brd1E9PZ26 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Brd1E9PZ26 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Brd1E9PZ26 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Brd1E9PZ26 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Brd1E9PZ26 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Brd1E9PZ26 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Brd1E9PZ26 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Brd1E9PZ26 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Brd1E9PZ26 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Brd1E9PZ26 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Brd1E9PZ26 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Brd1E9PZ26 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Brd1E9PZ26 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Brd1E9PZ26 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Brd1E9PZ26 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Brd1E9PZ26 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Brd1E9PZ26 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Brd1E9PZ26 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Brd1E9PZ26 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Brd1E9PZ26 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Brd1E9PZ26 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Brd1E9PZ26 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Brd1E9PZ26 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Brd1E9PZ26 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Brd1E9PZ26 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Brd1E9PZ26 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Brd1E9PZ26 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Brd1E9PZ26 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms