Protein–RNA interactions for Protein: E9PW10

Triml2, Tripartite motif family-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Triml2E9PW10 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Triml2E9PW10 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Triml2E9PW10 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Triml2E9PW10 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Triml2E9PW10 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Triml2E9PW10 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Triml2E9PW10 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Triml2E9PW10 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Triml2E9PW10 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Triml2E9PW10 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Triml2E9PW10 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Triml2E9PW10 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Triml2E9PW10 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Triml2E9PW10 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Triml2E9PW10 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Triml2E9PW10 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Triml2E9PW10 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Triml2E9PW10 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Triml2E9PW10 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Triml2E9PW10 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Triml2E9PW10 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Triml2E9PW10 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Triml2E9PW10 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Triml2E9PW10 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Triml2E9PW10 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Triml2E9PW10 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Triml2E9PW10 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Triml2E9PW10 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Triml2E9PW10 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Triml2E9PW10 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Triml2E9PW10 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Triml2E9PW10 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Triml2E9PW10 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Triml2E9PW10 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Triml2E9PW10 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Triml2E9PW10 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Triml2E9PW10 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Triml2E9PW10 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Triml2E9PW10 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Triml2E9PW10 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Triml2E9PW10 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Triml2E9PW10 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Triml2E9PW10 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Triml2E9PW10 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Triml2E9PW10 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Triml2E9PW10 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Triml2E9PW10 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Triml2E9PW10 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Triml2E9PW10 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Triml2E9PW10 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Triml2E9PW10 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Triml2E9PW10 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Triml2E9PW10 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Triml2E9PW10 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Triml2E9PW10 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Triml2E9PW10 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Triml2E9PW10 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Triml2E9PW10 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Triml2E9PW10 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Triml2E9PW10 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Triml2E9PW10 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Triml2E9PW10 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Triml2E9PW10 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Triml2E9PW10 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Triml2E9PW10 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Triml2E9PW10 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Triml2E9PW10 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Triml2E9PW10 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Triml2E9PW10 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Triml2E9PW10 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Triml2E9PW10 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Triml2E9PW10 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Triml2E9PW10 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Triml2E9PW10 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Triml2E9PW10 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Triml2E9PW10 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Triml2E9PW10 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Triml2E9PW10 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Triml2E9PW10 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Triml2E9PW10 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Triml2E9PW10 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Triml2E9PW10 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Triml2E9PW10 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Triml2E9PW10 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Triml2E9PW10 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Triml2E9PW10 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Triml2E9PW10 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Triml2E9PW10 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Triml2E9PW10 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Triml2E9PW10 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Triml2E9PW10 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Triml2E9PW10 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Triml2E9PW10 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Triml2E9PW10 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Triml2E9PW10 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Triml2E9PW10 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Triml2E9PW10 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Triml2E9PW10 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Triml2E9PW10 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Triml2E9PW10 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms