Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ttc17E9PVB5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ttc17E9PVB5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ttc17E9PVB5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ttc17E9PVB5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ttc17E9PVB5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ttc17E9PVB5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ttc17E9PVB5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ttc17E9PVB5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ttc17E9PVB5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ttc17E9PVB5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ttc17E9PVB5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ttc17E9PVB5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ttc17E9PVB5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ttc17E9PVB5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ttc17E9PVB5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ttc17E9PVB5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ttc17E9PVB5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ttc17E9PVB5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ttc17E9PVB5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ttc17E9PVB5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ttc17E9PVB5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ttc17E9PVB5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ttc17E9PVB5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ttc17E9PVB5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ttc17E9PVB5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ttc17E9PVB5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ttc17E9PVB5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ttc17E9PVB5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ttc17E9PVB5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ttc17E9PVB5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ttc17E9PVB5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ttc17E9PVB5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ttc17E9PVB5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ttc17E9PVB5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ttc17E9PVB5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ttc17E9PVB5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Ttc17E9PVB5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ttc17E9PVB5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ttc17E9PVB5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ttc17E9PVB5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ttc17E9PVB5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ttc17E9PVB5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ttc17E9PVB5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ttc17E9PVB5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ttc17E9PVB5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ttc17E9PVB5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ttc17E9PVB5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ttc17E9PVB5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ttc17E9PVB5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ttc17E9PVB5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ttc17E9PVB5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ttc17E9PVB5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ttc17E9PVB5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ttc17E9PVB5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ttc17E9PVB5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ttc17E9PVB5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ttc17E9PVB5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ttc17E9PVB5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ttc17E9PVB5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ttc17E9PVB5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ttc17E9PVB5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ttc17E9PVB5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ttc17E9PVB5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ttc17E9PVB5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ttc17E9PVB5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ttc17E9PVB5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ttc17E9PVB5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ttc17E9PVB5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ttc17E9PVB5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ttc17E9PVB5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ttc17E9PVB5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ttc17E9PVB5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ttc17E9PVB5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ttc17E9PVB5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Ttc17E9PVB5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Ttc17E9PVB5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ttc17E9PVB5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ttc17E9PVB5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ttc17E9PVB5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ttc17E9PVB5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ttc17E9PVB5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ttc17E9PVB5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Ttc17E9PVB5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ttc17E9PVB5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ttc17E9PVB5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ttc17E9PVB5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ttc17E9PVB5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ttc17E9PVB5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ttc17E9PVB5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ttc17E9PVB5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ttc17E9PVB5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ttc17E9PVB5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ttc17E9PVB5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ttc17E9PVB5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ttc17E9PVB5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ttc17E9PVB5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ttc17E9PVB5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ttc17E9PVB5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ttc17E9PVB5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms