Protein–RNA interactions for Protein: E9PUD6

Zscan18, Zinc finger and SCAN domain-containing 18, mousemouse

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan18E9PUD6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Zscan18E9PUD6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Zscan18E9PUD6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Zscan18E9PUD6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Zscan18E9PUD6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Zscan18E9PUD6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Zscan18E9PUD6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Zscan18E9PUD6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Zscan18E9PUD6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Zscan18E9PUD6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Zscan18E9PUD6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Zscan18E9PUD6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Zscan18E9PUD6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Zscan18E9PUD6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Zscan18E9PUD6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Zscan18E9PUD6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Zscan18E9PUD6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Zscan18E9PUD6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Zscan18E9PUD6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Zscan18E9PUD6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Zscan18E9PUD6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Zscan18E9PUD6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Zscan18E9PUD6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Zscan18E9PUD6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Zscan18E9PUD6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Zscan18E9PUD6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Zscan18E9PUD6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Zscan18E9PUD6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Zscan18E9PUD6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Zscan18E9PUD6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Zscan18E9PUD6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Zscan18E9PUD6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Zscan18E9PUD6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Zscan18E9PUD6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Zscan18E9PUD6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Zscan18E9PUD6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Zscan18E9PUD6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Zscan18E9PUD6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Zscan18E9PUD6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Zscan18E9PUD6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Zscan18E9PUD6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Zscan18E9PUD6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Zscan18E9PUD6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Zscan18E9PUD6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Zscan18E9PUD6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Zscan18E9PUD6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Zscan18E9PUD6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Zscan18E9PUD6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Zscan18E9PUD6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Zscan18E9PUD6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Zscan18E9PUD6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Zscan18E9PUD6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Zscan18E9PUD6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Zscan18E9PUD6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Zscan18E9PUD6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Zscan18E9PUD6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Zscan18E9PUD6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Zscan18E9PUD6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Zscan18E9PUD6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Zscan18E9PUD6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Zscan18E9PUD6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Zscan18E9PUD6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Zscan18E9PUD6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Zscan18E9PUD6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Zscan18E9PUD6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Zscan18E9PUD6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Zscan18E9PUD6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Zscan18E9PUD6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Zscan18E9PUD6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Zscan18E9PUD6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Zscan18E9PUD6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Zscan18E9PUD6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Zscan18E9PUD6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Zscan18E9PUD6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Zscan18E9PUD6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Zscan18E9PUD6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Zscan18E9PUD6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Zscan18E9PUD6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Zscan18E9PUD6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Zscan18E9PUD6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Zscan18E9PUD6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Zscan18E9PUD6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Zscan18E9PUD6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Zscan18E9PUD6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Zscan18E9PUD6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Zscan18E9PUD6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Zscan18E9PUD6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Zscan18E9PUD6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Zscan18E9PUD6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Zscan18E9PUD6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Zscan18E9PUD6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Zscan18E9PUD6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Zscan18E9PUD6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Zscan18E9PUD6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Zscan18E9PUD6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Zscan18E9PUD6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Zscan18E9PUD6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Zscan18E9PUD6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Zscan18E9PUD6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Zscan18E9PUD6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms