Protein–RNA interactions for Protein: E1U8D0

Soga1, Protein SOGA1, mousemouse

Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga1E1U8D0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Soga1E1U8D0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
Soga1E1U8D0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC36.51■■■■□ 3.44
Soga1E1U8D0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
Soga1E1U8D0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
Soga1E1U8D0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Soga1E1U8D0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
Soga1E1U8D0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
Soga1E1U8D0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
Soga1E1U8D0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
Soga1E1U8D0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Soga1E1U8D0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
Soga1E1U8D0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Soga1E1U8D0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
Soga1E1U8D0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Soga1E1U8D0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Soga1E1U8D0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Soga1E1U8D0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Soga1E1U8D0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Soga1E1U8D0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
Soga1E1U8D0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Soga1E1U8D0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Soga1E1U8D0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Soga1E1U8D0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Soga1E1U8D0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Soga1E1U8D0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
Soga1E1U8D0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Soga1E1U8D0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Soga1E1U8D0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Soga1E1U8D0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Soga1E1U8D0 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Soga1E1U8D0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Soga1E1U8D0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
Soga1E1U8D0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Soga1E1U8D0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Soga1E1U8D0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Soga1E1U8D0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Soga1E1U8D0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Soga1E1U8D0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Soga1E1U8D0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
Soga1E1U8D0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Soga1E1U8D0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Soga1E1U8D0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
Soga1E1U8D0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Soga1E1U8D0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Soga1E1U8D0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Soga1E1U8D0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Soga1E1U8D0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Soga1E1U8D0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Soga1E1U8D0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Soga1E1U8D0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
Soga1E1U8D0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Soga1E1U8D0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Soga1E1U8D0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Soga1E1U8D0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
Soga1E1U8D0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.41
Soga1E1U8D0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
Soga1E1U8D0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.41
Soga1E1U8D0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Soga1E1U8D0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Soga1E1U8D0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Soga1E1U8D0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Soga1E1U8D0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Soga1E1U8D0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Soga1E1U8D0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Soga1E1U8D0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Soga1E1U8D0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Soga1E1U8D0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Soga1E1U8D0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
Soga1E1U8D0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
Soga1E1U8D0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Soga1E1U8D0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC36.26■■■■□ 3.4
Soga1E1U8D0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Soga1E1U8D0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Soga1E1U8D0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Soga1E1U8D0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Soga1E1U8D0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Soga1E1U8D0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
Soga1E1U8D0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
Soga1E1U8D0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
Soga1E1U8D0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Soga1E1U8D0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Soga1E1U8D0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Soga1E1U8D0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Soga1E1U8D0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
Soga1E1U8D0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC36.2■■■■□ 3.39
Soga1E1U8D0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Soga1E1U8D0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Soga1E1U8D0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Soga1E1U8D0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Soga1E1U8D0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Soga1E1U8D0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
Soga1E1U8D0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Soga1E1U8D0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
Soga1E1U8D0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Soga1E1U8D0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Soga1E1U8D0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Soga1E1U8D0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Soga1E1U8D0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Soga1E1U8D0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms