Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5W0

Atp6ap1l, ATPase, H+-transporting, lysosomal accessory protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1lD3Z5W0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp6ap1lD3Z5W0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp6ap1lD3Z5W0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp6ap1lD3Z5W0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp6ap1lD3Z5W0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp6ap1lD3Z5W0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp6ap1lD3Z5W0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp6ap1lD3Z5W0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp6ap1lD3Z5W0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp6ap1lD3Z5W0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp6ap1lD3Z5W0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp6ap1lD3Z5W0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp6ap1lD3Z5W0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp6ap1lD3Z5W0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp6ap1lD3Z5W0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp6ap1lD3Z5W0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp6ap1lD3Z5W0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp6ap1lD3Z5W0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp6ap1lD3Z5W0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp6ap1lD3Z5W0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp6ap1lD3Z5W0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp6ap1lD3Z5W0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp6ap1lD3Z5W0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp6ap1lD3Z5W0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp6ap1lD3Z5W0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms