Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3U4

9630041A04Rik, RIKEN cDNA 9630041A04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9630041A04RikD3Z3U4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
9630041A04RikD3Z3U4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
9630041A04RikD3Z3U4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
9630041A04RikD3Z3U4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
9630041A04RikD3Z3U4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
9630041A04RikD3Z3U4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
9630041A04RikD3Z3U4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
9630041A04RikD3Z3U4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
9630041A04RikD3Z3U4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
9630041A04RikD3Z3U4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
9630041A04RikD3Z3U4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
9630041A04RikD3Z3U4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
9630041A04RikD3Z3U4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
9630041A04RikD3Z3U4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
9630041A04RikD3Z3U4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
9630041A04RikD3Z3U4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
9630041A04RikD3Z3U4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
9630041A04RikD3Z3U4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
9630041A04RikD3Z3U4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
9630041A04RikD3Z3U4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
9630041A04RikD3Z3U4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
9630041A04RikD3Z3U4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
9630041A04RikD3Z3U4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
9630041A04RikD3Z3U4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
9630041A04RikD3Z3U4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
9630041A04RikD3Z3U4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
9630041A04RikD3Z3U4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
9630041A04RikD3Z3U4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
9630041A04RikD3Z3U4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
9630041A04RikD3Z3U4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
9630041A04RikD3Z3U4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
9630041A04RikD3Z3U4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
9630041A04RikD3Z3U4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
9630041A04RikD3Z3U4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
9630041A04RikD3Z3U4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
9630041A04RikD3Z3U4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
9630041A04RikD3Z3U4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
9630041A04RikD3Z3U4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
9630041A04RikD3Z3U4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
9630041A04RikD3Z3U4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
9630041A04RikD3Z3U4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
9630041A04RikD3Z3U4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
9630041A04RikD3Z3U4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
9630041A04RikD3Z3U4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
9630041A04RikD3Z3U4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
9630041A04RikD3Z3U4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
9630041A04RikD3Z3U4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
9630041A04RikD3Z3U4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
9630041A04RikD3Z3U4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
9630041A04RikD3Z3U4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
9630041A04RikD3Z3U4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
9630041A04RikD3Z3U4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
9630041A04RikD3Z3U4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
9630041A04RikD3Z3U4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
9630041A04RikD3Z3U4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
9630041A04RikD3Z3U4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
9630041A04RikD3Z3U4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
9630041A04RikD3Z3U4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
9630041A04RikD3Z3U4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
9630041A04RikD3Z3U4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
9630041A04RikD3Z3U4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
9630041A04RikD3Z3U4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
9630041A04RikD3Z3U4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
9630041A04RikD3Z3U4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
9630041A04RikD3Z3U4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
9630041A04RikD3Z3U4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
9630041A04RikD3Z3U4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
9630041A04RikD3Z3U4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
9630041A04RikD3Z3U4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
9630041A04RikD3Z3U4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
9630041A04RikD3Z3U4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
9630041A04RikD3Z3U4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
9630041A04RikD3Z3U4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
9630041A04RikD3Z3U4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
9630041A04RikD3Z3U4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
9630041A04RikD3Z3U4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
9630041A04RikD3Z3U4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
9630041A04RikD3Z3U4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
9630041A04RikD3Z3U4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
9630041A04RikD3Z3U4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
9630041A04RikD3Z3U4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
9630041A04RikD3Z3U4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
9630041A04RikD3Z3U4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
9630041A04RikD3Z3U4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
9630041A04RikD3Z3U4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
9630041A04RikD3Z3U4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
9630041A04RikD3Z3U4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
9630041A04RikD3Z3U4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
9630041A04RikD3Z3U4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
9630041A04RikD3Z3U4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
9630041A04RikD3Z3U4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
9630041A04RikD3Z3U4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
9630041A04RikD3Z3U4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
9630041A04RikD3Z3U4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
9630041A04RikD3Z3U4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
9630041A04RikD3Z3U4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
9630041A04RikD3Z3U4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
9630041A04RikD3Z3U4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
9630041A04RikD3Z3U4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
9630041A04RikD3Z3U4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms