Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ80

Pdzd8, PDZ domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd8B9EJ80 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pdzd8B9EJ80 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pdzd8B9EJ80 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdzd8B9EJ80 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdzd8B9EJ80 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdzd8B9EJ80 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdzd8B9EJ80 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Pdzd8B9EJ80 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Pdzd8B9EJ80 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pdzd8B9EJ80 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pdzd8B9EJ80 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pdzd8B9EJ80 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pdzd8B9EJ80 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdzd8B9EJ80 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdzd8B9EJ80 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdzd8B9EJ80 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdzd8B9EJ80 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdzd8B9EJ80 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdzd8B9EJ80 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pdzd8B9EJ80 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pdzd8B9EJ80 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pdzd8B9EJ80 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Pdzd8B9EJ80 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pdzd8B9EJ80 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pdzd8B9EJ80 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pdzd8B9EJ80 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pdzd8B9EJ80 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdzd8B9EJ80 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdzd8B9EJ80 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pdzd8B9EJ80 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pdzd8B9EJ80 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pdzd8B9EJ80 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pdzd8B9EJ80 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pdzd8B9EJ80 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pdzd8B9EJ80 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Pdzd8B9EJ80 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Pdzd8B9EJ80 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdzd8B9EJ80 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdzd8B9EJ80 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdzd8B9EJ80 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdzd8B9EJ80 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdzd8B9EJ80 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdzd8B9EJ80 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdzd8B9EJ80 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdzd8B9EJ80 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdzd8B9EJ80 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdzd8B9EJ80 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdzd8B9EJ80 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdzd8B9EJ80 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdzd8B9EJ80 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdzd8B9EJ80 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdzd8B9EJ80 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdzd8B9EJ80 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdzd8B9EJ80 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdzd8B9EJ80 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdzd8B9EJ80 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdzd8B9EJ80 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdzd8B9EJ80 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdzd8B9EJ80 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdzd8B9EJ80 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdzd8B9EJ80 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdzd8B9EJ80 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdzd8B9EJ80 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdzd8B9EJ80 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdzd8B9EJ80 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pdzd8B9EJ80 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pdzd8B9EJ80 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pdzd8B9EJ80 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pdzd8B9EJ80 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pdzd8B9EJ80 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pdzd8B9EJ80 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pdzd8B9EJ80 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pdzd8B9EJ80 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pdzd8B9EJ80 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pdzd8B9EJ80 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pdzd8B9EJ80 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pdzd8B9EJ80 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdzd8B9EJ80 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdzd8B9EJ80 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdzd8B9EJ80 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdzd8B9EJ80 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pdzd8B9EJ80 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pdzd8B9EJ80 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pdzd8B9EJ80 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pdzd8B9EJ80 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Pdzd8B9EJ80 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pdzd8B9EJ80 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pdzd8B9EJ80 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pdzd8B9EJ80 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pdzd8B9EJ80 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pdzd8B9EJ80 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pdzd8B9EJ80 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pdzd8B9EJ80 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdzd8B9EJ80 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdzd8B9EJ80 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdzd8B9EJ80 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdzd8B9EJ80 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdzd8B9EJ80 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdzd8B9EJ80 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdzd8B9EJ80 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms