Protein–RNA interactions for Protein: B2RXC1

Trappc11, Trafficking protein particle complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc11B2RXC1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trappc11B2RXC1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trappc11B2RXC1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trappc11B2RXC1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Trappc11B2RXC1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trappc11B2RXC1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trappc11B2RXC1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trappc11B2RXC1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trappc11B2RXC1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Trappc11B2RXC1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trappc11B2RXC1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trappc11B2RXC1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trappc11B2RXC1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trappc11B2RXC1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trappc11B2RXC1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Trappc11B2RXC1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trappc11B2RXC1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trappc11B2RXC1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trappc11B2RXC1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trappc11B2RXC1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trappc11B2RXC1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trappc11B2RXC1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trappc11B2RXC1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trappc11B2RXC1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Trappc11B2RXC1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trappc11B2RXC1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trappc11B2RXC1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trappc11B2RXC1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trappc11B2RXC1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trappc11B2RXC1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trappc11B2RXC1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trappc11B2RXC1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Trappc11B2RXC1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trappc11B2RXC1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Trappc11B2RXC1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trappc11B2RXC1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trappc11B2RXC1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trappc11B2RXC1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trappc11B2RXC1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Trappc11B2RXC1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Trappc11B2RXC1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trappc11B2RXC1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trappc11B2RXC1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trappc11B2RXC1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trappc11B2RXC1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trappc11B2RXC1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trappc11B2RXC1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trappc11B2RXC1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trappc11B2RXC1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trappc11B2RXC1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trappc11B2RXC1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trappc11B2RXC1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Trappc11B2RXC1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trappc11B2RXC1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trappc11B2RXC1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trappc11B2RXC1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trappc11B2RXC1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trappc11B2RXC1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trappc11B2RXC1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trappc11B2RXC1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trappc11B2RXC1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trappc11B2RXC1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trappc11B2RXC1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trappc11B2RXC1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trappc11B2RXC1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trappc11B2RXC1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trappc11B2RXC1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trappc11B2RXC1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trappc11B2RXC1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trappc11B2RXC1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trappc11B2RXC1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trappc11B2RXC1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trappc11B2RXC1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trappc11B2RXC1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trappc11B2RXC1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trappc11B2RXC1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trappc11B2RXC1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trappc11B2RXC1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trappc11B2RXC1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trappc11B2RXC1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trappc11B2RXC1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trappc11B2RXC1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trappc11B2RXC1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trappc11B2RXC1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trappc11B2RXC1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trappc11B2RXC1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trappc11B2RXC1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trappc11B2RXC1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trappc11B2RXC1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Trappc11B2RXC1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trappc11B2RXC1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trappc11B2RXC1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trappc11B2RXC1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trappc11B2RXC1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Trappc11B2RXC1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trappc11B2RXC1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trappc11B2RXC1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trappc11B2RXC1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trappc11B2RXC1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trappc11B2RXC1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms