Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zbed5B2RPU8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zbed5B2RPU8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zbed5B2RPU8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zbed5B2RPU8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zbed5B2RPU8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zbed5B2RPU8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zbed5B2RPU8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zbed5B2RPU8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zbed5B2RPU8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zbed5B2RPU8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Zbed5B2RPU8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zbed5B2RPU8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zbed5B2RPU8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zbed5B2RPU8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zbed5B2RPU8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zbed5B2RPU8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zbed5B2RPU8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zbed5B2RPU8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Zbed5B2RPU8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Zbed5B2RPU8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zbed5B2RPU8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zbed5B2RPU8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zbed5B2RPU8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zbed5B2RPU8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zbed5B2RPU8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zbed5B2RPU8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zbed5B2RPU8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Zbed5B2RPU8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zbed5B2RPU8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zbed5B2RPU8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zbed5B2RPU8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zbed5B2RPU8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zbed5B2RPU8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zbed5B2RPU8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zbed5B2RPU8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zbed5B2RPU8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zbed5B2RPU8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zbed5B2RPU8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zbed5B2RPU8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zbed5B2RPU8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zbed5B2RPU8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zbed5B2RPU8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Zbed5B2RPU8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zbed5B2RPU8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zbed5B2RPU8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zbed5B2RPU8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zbed5B2RPU8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zbed5B2RPU8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zbed5B2RPU8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zbed5B2RPU8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zbed5B2RPU8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zbed5B2RPU8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zbed5B2RPU8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zbed5B2RPU8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Zbed5B2RPU8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Zbed5B2RPU8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zbed5B2RPU8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Zbed5B2RPU8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zbed5B2RPU8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zbed5B2RPU8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zbed5B2RPU8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zbed5B2RPU8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zbed5B2RPU8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zbed5B2RPU8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zbed5B2RPU8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zbed5B2RPU8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zbed5B2RPU8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Zbed5B2RPU8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zbed5B2RPU8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zbed5B2RPU8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zbed5B2RPU8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zbed5B2RPU8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zbed5B2RPU8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zbed5B2RPU8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zbed5B2RPU8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Zbed5B2RPU8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zbed5B2RPU8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zbed5B2RPU8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zbed5B2RPU8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zbed5B2RPU8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zbed5B2RPU8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zbed5B2RPU8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zbed5B2RPU8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Zbed5B2RPU8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zbed5B2RPU8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zbed5B2RPU8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zbed5B2RPU8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zbed5B2RPU8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zbed5B2RPU8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zbed5B2RPU8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zbed5B2RPU8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zbed5B2RPU8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zbed5B2RPU8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zbed5B2RPU8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zbed5B2RPU8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Zbed5B2RPU8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zbed5B2RPU8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Zbed5B2RPU8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zbed5B2RPU8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.9 ms