Protein–RNA interactions for Protein: B1B0R1

Gm2012, Predicted gene 2012, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2012B1B0R1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm2012B1B0R1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm2012B1B0R1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm2012B1B0R1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm2012B1B0R1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm2012B1B0R1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm2012B1B0R1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm2012B1B0R1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm2012B1B0R1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm2012B1B0R1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm2012B1B0R1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gm2012B1B0R1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gm2012B1B0R1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Gm2012B1B0R1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gm2012B1B0R1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm2012B1B0R1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm2012B1B0R1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm2012B1B0R1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm2012B1B0R1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm2012B1B0R1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm2012B1B0R1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm2012B1B0R1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm2012B1B0R1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm2012B1B0R1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm2012B1B0R1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm2012B1B0R1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm2012B1B0R1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm2012B1B0R1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm2012B1B0R1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm2012B1B0R1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm2012B1B0R1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm2012B1B0R1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm2012B1B0R1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm2012B1B0R1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm2012B1B0R1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm2012B1B0R1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm2012B1B0R1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm2012B1B0R1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm2012B1B0R1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm2012B1B0R1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm2012B1B0R1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm2012B1B0R1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm2012B1B0R1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm2012B1B0R1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm2012B1B0R1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm2012B1B0R1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm2012B1B0R1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm2012B1B0R1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm2012B1B0R1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm2012B1B0R1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm2012B1B0R1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm2012B1B0R1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm2012B1B0R1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm2012B1B0R1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm2012B1B0R1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm2012B1B0R1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm2012B1B0R1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm2012B1B0R1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm2012B1B0R1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm2012B1B0R1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm2012B1B0R1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm2012B1B0R1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm2012B1B0R1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm2012B1B0R1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm2012B1B0R1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm2012B1B0R1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm2012B1B0R1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm2012B1B0R1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm2012B1B0R1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm2012B1B0R1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm2012B1B0R1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm2012B1B0R1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm2012B1B0R1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm2012B1B0R1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm2012B1B0R1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm2012B1B0R1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm2012B1B0R1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm2012B1B0R1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm2012B1B0R1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm2012B1B0R1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm2012B1B0R1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm2012B1B0R1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm2012B1B0R1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm2012B1B0R1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm2012B1B0R1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm2012B1B0R1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Gm2012B1B0R1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm2012B1B0R1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm2012B1B0R1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm2012B1B0R1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm2012B1B0R1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm2012B1B0R1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm2012B1B0R1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm2012B1B0R1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm2012B1B0R1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm2012B1B0R1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm2012B1B0R1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm2012B1B0R1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm2012B1B0R1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm2012B1B0R1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms