Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ssxb8B1AY40 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssxb8B1AY40 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssxb8B1AY40 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssxb8B1AY40 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssxb8B1AY40 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssxb8B1AY40 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssxb8B1AY40 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssxb8B1AY40 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssxb8B1AY40 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssxb8B1AY40 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssxb8B1AY40 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssxb8B1AY40 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssxb8B1AY40 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ssxb8B1AY40 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ssxb8B1AY40 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ssxb8B1AY40 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ssxb8B1AY40 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ssxb8B1AY40 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ssxb8B1AY40 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ssxb8B1AY40 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ssxb8B1AY40 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ssxb8B1AY40 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ssxb8B1AY40 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ssxb8B1AY40 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ssxb8B1AY40 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ssxb8B1AY40 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ssxb8B1AY40 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ssxb8B1AY40 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ssxb8B1AY40 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ssxb8B1AY40 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ssxb8B1AY40 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ssxb8B1AY40 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ssxb8B1AY40 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ssxb8B1AY40 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ssxb8B1AY40 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ssxb8B1AY40 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ssxb8B1AY40 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ssxb8B1AY40 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ssxb8B1AY40 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ssxb8B1AY40 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ssxb8B1AY40 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ssxb8B1AY40 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ssxb8B1AY40 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ssxb8B1AY40 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ssxb8B1AY40 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ssxb8B1AY40 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ssxb8B1AY40 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ssxb8B1AY40 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ssxb8B1AY40 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ssxb8B1AY40 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ssxb8B1AY40 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ssxb8B1AY40 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ssxb8B1AY40 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ssxb8B1AY40 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ssxb8B1AY40 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ssxb8B1AY40 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ssxb8B1AY40 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ssxb8B1AY40 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ssxb8B1AY40 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ssxb8B1AY40 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ssxb8B1AY40 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ssxb8B1AY40 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ssxb8B1AY40 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ssxb8B1AY40 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ssxb8B1AY40 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ssxb8B1AY40 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ssxb8B1AY40 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ssxb8B1AY40 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ssxb8B1AY40 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ssxb8B1AY40 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ssxb8B1AY40 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ssxb8B1AY40 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ssxb8B1AY40 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ssxb8B1AY40 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ssxb8B1AY40 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ssxb8B1AY40 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ssxb8B1AY40 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ssxb8B1AY40 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ssxb8B1AY40 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ssxb8B1AY40 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ssxb8B1AY40 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ssxb8B1AY40 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ssxb8B1AY40 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ssxb8B1AY40 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ssxb8B1AY40 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ssxb8B1AY40 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ssxb8B1AY40 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ssxb8B1AY40 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ssxb8B1AY40 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ssxb8B1AY40 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ssxb8B1AY40 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ssxb8B1AY40 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ssxb8B1AY40 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ssxb8B1AY40 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ssxb8B1AY40 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ssxb8B1AY40 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ssxb8B1AY40 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ssxb8B1AY40 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ssxb8B1AY40 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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