Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB3

Gm438, MCG65768, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm438B1ASB3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm438B1ASB3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm438B1ASB3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm438B1ASB3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm438B1ASB3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm438B1ASB3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm438B1ASB3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm438B1ASB3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm438B1ASB3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm438B1ASB3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm438B1ASB3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm438B1ASB3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm438B1ASB3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm438B1ASB3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm438B1ASB3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm438B1ASB3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm438B1ASB3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm438B1ASB3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm438B1ASB3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm438B1ASB3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm438B1ASB3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm438B1ASB3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm438B1ASB3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm438B1ASB3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm438B1ASB3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm438B1ASB3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm438B1ASB3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm438B1ASB3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm438B1ASB3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm438B1ASB3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm438B1ASB3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm438B1ASB3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm438B1ASB3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm438B1ASB3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm438B1ASB3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm438B1ASB3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm438B1ASB3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gm438B1ASB3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm438B1ASB3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm438B1ASB3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm438B1ASB3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm438B1ASB3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm438B1ASB3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm438B1ASB3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm438B1ASB3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm438B1ASB3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm438B1ASB3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm438B1ASB3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm438B1ASB3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm438B1ASB3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm438B1ASB3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm438B1ASB3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm438B1ASB3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm438B1ASB3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm438B1ASB3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm438B1ASB3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm438B1ASB3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm438B1ASB3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm438B1ASB3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm438B1ASB3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm438B1ASB3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm438B1ASB3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm438B1ASB3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm438B1ASB3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm438B1ASB3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm438B1ASB3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm438B1ASB3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm438B1ASB3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm438B1ASB3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm438B1ASB3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm438B1ASB3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm438B1ASB3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm438B1ASB3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm438B1ASB3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm438B1ASB3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm438B1ASB3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm438B1ASB3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm438B1ASB3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm438B1ASB3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm438B1ASB3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm438B1ASB3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm438B1ASB3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm438B1ASB3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm438B1ASB3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm438B1ASB3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm438B1ASB3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm438B1ASB3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm438B1ASB3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm438B1ASB3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm438B1ASB3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm438B1ASB3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm438B1ASB3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm438B1ASB3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm438B1ASB3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm438B1ASB3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm438B1ASB3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm438B1ASB3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm438B1ASB3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm438B1ASB3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm438B1ASB3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms