Protein–RNA interactions for Protein: B0QZW4

Supt3, Suppressor of Ty 3 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt3B0QZW4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Supt3B0QZW4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Supt3B0QZW4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Supt3B0QZW4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Supt3B0QZW4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Supt3B0QZW4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Supt3B0QZW4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Supt3B0QZW4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Supt3B0QZW4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Supt3B0QZW4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Supt3B0QZW4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Supt3B0QZW4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Supt3B0QZW4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Supt3B0QZW4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Supt3B0QZW4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Supt3B0QZW4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Supt3B0QZW4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Supt3B0QZW4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Supt3B0QZW4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Supt3B0QZW4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Supt3B0QZW4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Supt3B0QZW4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Supt3B0QZW4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Supt3B0QZW4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Supt3B0QZW4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Supt3B0QZW4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Supt3B0QZW4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Supt3B0QZW4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Supt3B0QZW4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Supt3B0QZW4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Supt3B0QZW4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Supt3B0QZW4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Supt3B0QZW4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Supt3B0QZW4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Supt3B0QZW4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Supt3B0QZW4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Supt3B0QZW4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Supt3B0QZW4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Supt3B0QZW4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Supt3B0QZW4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Supt3B0QZW4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Supt3B0QZW4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Supt3B0QZW4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Supt3B0QZW4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Supt3B0QZW4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Supt3B0QZW4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Supt3B0QZW4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Supt3B0QZW4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Supt3B0QZW4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Supt3B0QZW4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Supt3B0QZW4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Supt3B0QZW4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Supt3B0QZW4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Supt3B0QZW4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Supt3B0QZW4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Supt3B0QZW4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Supt3B0QZW4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Supt3B0QZW4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Supt3B0QZW4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Supt3B0QZW4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Supt3B0QZW4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Supt3B0QZW4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Supt3B0QZW4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Supt3B0QZW4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Supt3B0QZW4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Supt3B0QZW4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Supt3B0QZW4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Supt3B0QZW4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Supt3B0QZW4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Supt3B0QZW4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Supt3B0QZW4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Supt3B0QZW4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Supt3B0QZW4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Supt3B0QZW4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Supt3B0QZW4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Supt3B0QZW4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Supt3B0QZW4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Supt3B0QZW4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Supt3B0QZW4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Supt3B0QZW4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Supt3B0QZW4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Supt3B0QZW4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Supt3B0QZW4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Supt3B0QZW4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Supt3B0QZW4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Supt3B0QZW4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Supt3B0QZW4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Supt3B0QZW4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Supt3B0QZW4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Supt3B0QZW4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Supt3B0QZW4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Supt3B0QZW4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Supt3B0QZW4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Supt3B0QZW4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Supt3B0QZW4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Supt3B0QZW4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Supt3B0QZW4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Supt3B0QZW4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Supt3B0QZW4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Supt3B0QZW4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms