Protein–RNA interactions for Protein: B0QZF7

Proca1, Protein PROCA1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Proca1B0QZF7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Proca1B0QZF7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Proca1B0QZF7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Proca1B0QZF7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Proca1B0QZF7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Proca1B0QZF7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Proca1B0QZF7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Proca1B0QZF7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Proca1B0QZF7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Proca1B0QZF7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Proca1B0QZF7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Proca1B0QZF7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Proca1B0QZF7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Proca1B0QZF7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Proca1B0QZF7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Proca1B0QZF7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Proca1B0QZF7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Proca1B0QZF7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Proca1B0QZF7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Proca1B0QZF7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Proca1B0QZF7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Proca1B0QZF7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Proca1B0QZF7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Proca1B0QZF7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Proca1B0QZF7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Proca1B0QZF7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Proca1B0QZF7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Proca1B0QZF7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Proca1B0QZF7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Proca1B0QZF7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Proca1B0QZF7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Proca1B0QZF7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Proca1B0QZF7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Proca1B0QZF7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Proca1B0QZF7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Proca1B0QZF7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Proca1B0QZF7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Proca1B0QZF7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Proca1B0QZF7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Proca1B0QZF7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Proca1B0QZF7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Proca1B0QZF7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Proca1B0QZF7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Proca1B0QZF7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Proca1B0QZF7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Proca1B0QZF7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Proca1B0QZF7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Proca1B0QZF7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Proca1B0QZF7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Proca1B0QZF7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Proca1B0QZF7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Proca1B0QZF7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Proca1B0QZF7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Proca1B0QZF7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Proca1B0QZF7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Proca1B0QZF7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Proca1B0QZF7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Proca1B0QZF7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Proca1B0QZF7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Proca1B0QZF7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Proca1B0QZF7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Proca1B0QZF7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Proca1B0QZF7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Proca1B0QZF7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Proca1B0QZF7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Proca1B0QZF7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Proca1B0QZF7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Proca1B0QZF7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Proca1B0QZF7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Proca1B0QZF7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Proca1B0QZF7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Proca1B0QZF7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Proca1B0QZF7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Proca1B0QZF7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Proca1B0QZF7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Proca1B0QZF7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Proca1B0QZF7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Proca1B0QZF7 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Proca1B0QZF7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Proca1B0QZF7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Proca1B0QZF7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Proca1B0QZF7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Proca1B0QZF7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Proca1B0QZF7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Proca1B0QZF7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Proca1B0QZF7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Proca1B0QZF7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Proca1B0QZF7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Proca1B0QZF7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Proca1B0QZF7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Proca1B0QZF7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Proca1B0QZF7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Proca1B0QZF7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Proca1B0QZF7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Proca1B0QZF7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Proca1B0QZF7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Proca1B0QZF7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Proca1B0QZF7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Proca1B0QZF7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Proca1B0QZF7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms