Protein–RNA interactions for Protein: A7XV04

Skint7, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint7A7XV04 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Skint7A7XV04 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Skint7A7XV04 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Skint7A7XV04 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Skint7A7XV04 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Skint7A7XV04 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Skint7A7XV04 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Skint7A7XV04 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Skint7A7XV04 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Skint7A7XV04 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Skint7A7XV04 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Skint7A7XV04 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Skint7A7XV04 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Skint7A7XV04 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Skint7A7XV04 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Skint7A7XV04 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Skint7A7XV04 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Skint7A7XV04 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Skint7A7XV04 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Skint7A7XV04 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Skint7A7XV04 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Skint7A7XV04 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Skint7A7XV04 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Skint7A7XV04 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Skint7A7XV04 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Skint7A7XV04 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Skint7A7XV04 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Skint7A7XV04 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Skint7A7XV04 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Skint7A7XV04 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Skint7A7XV04 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Skint7A7XV04 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Skint7A7XV04 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Skint7A7XV04 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Skint7A7XV04 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Skint7A7XV04 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Skint7A7XV04 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Skint7A7XV04 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Skint7A7XV04 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Skint7A7XV04 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Skint7A7XV04 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Skint7A7XV04 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Skint7A7XV04 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Skint7A7XV04 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Skint7A7XV04 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Skint7A7XV04 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Skint7A7XV04 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Skint7A7XV04 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Skint7A7XV04 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Skint7A7XV04 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Skint7A7XV04 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Skint7A7XV04 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Skint7A7XV04 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Skint7A7XV04 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Skint7A7XV04 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Skint7A7XV04 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Skint7A7XV04 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Skint7A7XV04 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Skint7A7XV04 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Skint7A7XV04 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Skint7A7XV04 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Skint7A7XV04 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Skint7A7XV04 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Skint7A7XV04 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Skint7A7XV04 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Skint7A7XV04 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Skint7A7XV04 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Skint7A7XV04 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Skint7A7XV04 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Skint7A7XV04 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Skint7A7XV04 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Skint7A7XV04 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Skint7A7XV04 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Skint7A7XV04 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Skint7A7XV04 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Skint7A7XV04 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Skint7A7XV04 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Skint7A7XV04 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Skint7A7XV04 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Skint7A7XV04 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Skint7A7XV04 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Skint7A7XV04 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Skint7A7XV04 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Skint7A7XV04 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Skint7A7XV04 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Skint7A7XV04 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Skint7A7XV04 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Skint7A7XV04 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Skint7A7XV04 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Skint7A7XV04 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Skint7A7XV04 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Skint7A7XV04 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Skint7A7XV04 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Skint7A7XV04 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Skint7A7XV04 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Skint7A7XV04 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Skint7A7XV04 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Skint7A7XV04 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Skint7A7XV04 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Skint7A7XV04 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms