Protein–RNA interactions for Protein: A7L9Z8

Atp2c2, Calcium-transporting ATPase type 2C member 2, mousemouse

Predictions only

Length 944 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2c2A7L9Z8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp2c2A7L9Z8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp2c2A7L9Z8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp2c2A7L9Z8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp2c2A7L9Z8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp2c2A7L9Z8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp2c2A7L9Z8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp2c2A7L9Z8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp2c2A7L9Z8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp2c2A7L9Z8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp2c2A7L9Z8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp2c2A7L9Z8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Atp2c2A7L9Z8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atp2c2A7L9Z8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atp2c2A7L9Z8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atp2c2A7L9Z8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atp2c2A7L9Z8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atp2c2A7L9Z8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atp2c2A7L9Z8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp2c2A7L9Z8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp2c2A7L9Z8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp2c2A7L9Z8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp2c2A7L9Z8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp2c2A7L9Z8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp2c2A7L9Z8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp2c2A7L9Z8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp2c2A7L9Z8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp2c2A7L9Z8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp2c2A7L9Z8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp2c2A7L9Z8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp2c2A7L9Z8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp2c2A7L9Z8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp2c2A7L9Z8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp2c2A7L9Z8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp2c2A7L9Z8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp2c2A7L9Z8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp2c2A7L9Z8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp2c2A7L9Z8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp2c2A7L9Z8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp2c2A7L9Z8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp2c2A7L9Z8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp2c2A7L9Z8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp2c2A7L9Z8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp2c2A7L9Z8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp2c2A7L9Z8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Atp2c2A7L9Z8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp2c2A7L9Z8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp2c2A7L9Z8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp2c2A7L9Z8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp2c2A7L9Z8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp2c2A7L9Z8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp2c2A7L9Z8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp2c2A7L9Z8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp2c2A7L9Z8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp2c2A7L9Z8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp2c2A7L9Z8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp2c2A7L9Z8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp2c2A7L9Z8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp2c2A7L9Z8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp2c2A7L9Z8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp2c2A7L9Z8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp2c2A7L9Z8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp2c2A7L9Z8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp2c2A7L9Z8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp2c2A7L9Z8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp2c2A7L9Z8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp2c2A7L9Z8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp2c2A7L9Z8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp2c2A7L9Z8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Atp2c2A7L9Z8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Atp2c2A7L9Z8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Atp2c2A7L9Z8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp2c2A7L9Z8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Atp2c2A7L9Z8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp2c2A7L9Z8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Atp2c2A7L9Z8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp2c2A7L9Z8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp2c2A7L9Z8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp2c2A7L9Z8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp2c2A7L9Z8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp2c2A7L9Z8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp2c2A7L9Z8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp2c2A7L9Z8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp2c2A7L9Z8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp2c2A7L9Z8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp2c2A7L9Z8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Atp2c2A7L9Z8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atp2c2A7L9Z8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atp2c2A7L9Z8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atp2c2A7L9Z8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atp2c2A7L9Z8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atp2c2A7L9Z8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atp2c2A7L9Z8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atp2c2A7L9Z8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp2c2A7L9Z8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp2c2A7L9Z8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp2c2A7L9Z8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp2c2A7L9Z8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Atp2c2A7L9Z8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atp2c2A7L9Z8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms