Protein–RNA interactions for Protein: A6PWV5

Arid3c, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arid3cA6PWV5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Arid3cA6PWV5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Arid3cA6PWV5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Arid3cA6PWV5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC35.45■■■■□ 3.27
Arid3cA6PWV5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
Arid3cA6PWV5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Arid3cA6PWV5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
Arid3cA6PWV5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
Arid3cA6PWV5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Arid3cA6PWV5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Arid3cA6PWV5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Arid3cA6PWV5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC35.43■■■■□ 3.26
Arid3cA6PWV5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Arid3cA6PWV5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Arid3cA6PWV5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Arid3cA6PWV5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Arid3cA6PWV5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Arid3cA6PWV5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Arid3cA6PWV5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
Arid3cA6PWV5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Arid3cA6PWV5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Arid3cA6PWV5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Arid3cA6PWV5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Arid3cA6PWV5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Arid3cA6PWV5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Arid3cA6PWV5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Arid3cA6PWV5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Arid3cA6PWV5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Arid3cA6PWV5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
Arid3cA6PWV5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Arid3cA6PWV5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Arid3cA6PWV5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Arid3cA6PWV5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Arid3cA6PWV5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Arid3cA6PWV5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Arid3cA6PWV5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Arid3cA6PWV5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Arid3cA6PWV5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Arid3cA6PWV5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Arid3cA6PWV5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
Arid3cA6PWV5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
Arid3cA6PWV5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Arid3cA6PWV5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Arid3cA6PWV5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Arid3cA6PWV5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Arid3cA6PWV5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Arid3cA6PWV5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Arid3cA6PWV5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Arid3cA6PWV5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
Arid3cA6PWV5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC35.26■■■■□ 3.24
Arid3cA6PWV5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Arid3cA6PWV5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
Arid3cA6PWV5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Arid3cA6PWV5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Arid3cA6PWV5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Arid3cA6PWV5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Arid3cA6PWV5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Arid3cA6PWV5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Arid3cA6PWV5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Arid3cA6PWV5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Arid3cA6PWV5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Arid3cA6PWV5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Arid3cA6PWV5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Arid3cA6PWV5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Arid3cA6PWV5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Arid3cA6PWV5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Arid3cA6PWV5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Arid3cA6PWV5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Arid3cA6PWV5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Arid3cA6PWV5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Arid3cA6PWV5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Arid3cA6PWV5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Arid3cA6PWV5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
Arid3cA6PWV5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Arid3cA6PWV5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Arid3cA6PWV5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Arid3cA6PWV5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Arid3cA6PWV5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Arid3cA6PWV5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Arid3cA6PWV5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Arid3cA6PWV5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Arid3cA6PWV5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Arid3cA6PWV5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Arid3cA6PWV5 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
Arid3cA6PWV5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Arid3cA6PWV5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Arid3cA6PWV5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Arid3cA6PWV5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Arid3cA6PWV5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Arid3cA6PWV5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Arid3cA6PWV5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Arid3cA6PWV5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Arid3cA6PWV5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Arid3cA6PWV5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
Arid3cA6PWV5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
Arid3cA6PWV5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
Arid3cA6PWV5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Arid3cA6PWV5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Arid3cA6PWV5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Arid3cA6PWV5 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms