Protein–RNA interactions for Protein: A2RRY9

4930595M18Rik, RIKEN cDNA 4930595M18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930595M18RikA2RRY9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4930595M18RikA2RRY9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4930595M18RikA2RRY9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
4930595M18RikA2RRY9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4930595M18RikA2RRY9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4930595M18RikA2RRY9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4930595M18RikA2RRY9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
4930595M18RikA2RRY9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
4930595M18RikA2RRY9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
4930595M18RikA2RRY9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
4930595M18RikA2RRY9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
4930595M18RikA2RRY9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
4930595M18RikA2RRY9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
4930595M18RikA2RRY9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
4930595M18RikA2RRY9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
4930595M18RikA2RRY9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
4930595M18RikA2RRY9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4930595M18RikA2RRY9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4930595M18RikA2RRY9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
4930595M18RikA2RRY9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
4930595M18RikA2RRY9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
4930595M18RikA2RRY9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
4930595M18RikA2RRY9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
4930595M18RikA2RRY9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
4930595M18RikA2RRY9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
4930595M18RikA2RRY9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
4930595M18RikA2RRY9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
4930595M18RikA2RRY9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
4930595M18RikA2RRY9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
4930595M18RikA2RRY9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
4930595M18RikA2RRY9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
4930595M18RikA2RRY9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
4930595M18RikA2RRY9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
4930595M18RikA2RRY9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
4930595M18RikA2RRY9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
4930595M18RikA2RRY9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
4930595M18RikA2RRY9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
4930595M18RikA2RRY9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
4930595M18RikA2RRY9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
4930595M18RikA2RRY9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
4930595M18RikA2RRY9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
4930595M18RikA2RRY9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
4930595M18RikA2RRY9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
4930595M18RikA2RRY9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
4930595M18RikA2RRY9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
4930595M18RikA2RRY9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
4930595M18RikA2RRY9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
4930595M18RikA2RRY9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
4930595M18RikA2RRY9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
4930595M18RikA2RRY9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4930595M18RikA2RRY9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
4930595M18RikA2RRY9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
4930595M18RikA2RRY9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
4930595M18RikA2RRY9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
4930595M18RikA2RRY9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
4930595M18RikA2RRY9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
4930595M18RikA2RRY9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
4930595M18RikA2RRY9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
4930595M18RikA2RRY9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
4930595M18RikA2RRY9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
4930595M18RikA2RRY9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
4930595M18RikA2RRY9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
4930595M18RikA2RRY9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
4930595M18RikA2RRY9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
4930595M18RikA2RRY9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4930595M18RikA2RRY9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4930595M18RikA2RRY9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
4930595M18RikA2RRY9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4930595M18RikA2RRY9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
4930595M18RikA2RRY9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4930595M18RikA2RRY9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4930595M18RikA2RRY9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4930595M18RikA2RRY9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4930595M18RikA2RRY9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4930595M18RikA2RRY9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4930595M18RikA2RRY9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4930595M18RikA2RRY9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4930595M18RikA2RRY9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4930595M18RikA2RRY9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
4930595M18RikA2RRY9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
4930595M18RikA2RRY9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
4930595M18RikA2RRY9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
4930595M18RikA2RRY9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
4930595M18RikA2RRY9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
4930595M18RikA2RRY9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
4930595M18RikA2RRY9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
4930595M18RikA2RRY9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
4930595M18RikA2RRY9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
4930595M18RikA2RRY9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
4930595M18RikA2RRY9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
4930595M18RikA2RRY9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4930595M18RikA2RRY9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
4930595M18RikA2RRY9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4930595M18RikA2RRY9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
4930595M18RikA2RRY9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
4930595M18RikA2RRY9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
4930595M18RikA2RRY9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4930595M18RikA2RRY9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4930595M18RikA2RRY9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4930595M18RikA2RRY9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.9 ms