Protein–RNA interactions for Protein: A2ARI4

Lgr4, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr4A2ARI4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lgr4A2ARI4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lgr4A2ARI4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lgr4A2ARI4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lgr4A2ARI4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lgr4A2ARI4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lgr4A2ARI4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lgr4A2ARI4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lgr4A2ARI4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lgr4A2ARI4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lgr4A2ARI4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lgr4A2ARI4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lgr4A2ARI4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lgr4A2ARI4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lgr4A2ARI4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lgr4A2ARI4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Lgr4A2ARI4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lgr4A2ARI4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lgr4A2ARI4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lgr4A2ARI4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lgr4A2ARI4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lgr4A2ARI4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lgr4A2ARI4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lgr4A2ARI4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lgr4A2ARI4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lgr4A2ARI4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lgr4A2ARI4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lgr4A2ARI4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lgr4A2ARI4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lgr4A2ARI4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lgr4A2ARI4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lgr4A2ARI4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lgr4A2ARI4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lgr4A2ARI4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lgr4A2ARI4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lgr4A2ARI4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lgr4A2ARI4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lgr4A2ARI4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lgr4A2ARI4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lgr4A2ARI4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lgr4A2ARI4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lgr4A2ARI4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lgr4A2ARI4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lgr4A2ARI4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lgr4A2ARI4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Lgr4A2ARI4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Lgr4A2ARI4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lgr4A2ARI4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lgr4A2ARI4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lgr4A2ARI4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lgr4A2ARI4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lgr4A2ARI4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lgr4A2ARI4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lgr4A2ARI4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lgr4A2ARI4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lgr4A2ARI4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lgr4A2ARI4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lgr4A2ARI4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lgr4A2ARI4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lgr4A2ARI4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Lgr4A2ARI4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lgr4A2ARI4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lgr4A2ARI4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lgr4A2ARI4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lgr4A2ARI4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lgr4A2ARI4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lgr4A2ARI4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lgr4A2ARI4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lgr4A2ARI4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lgr4A2ARI4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lgr4A2ARI4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lgr4A2ARI4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lgr4A2ARI4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lgr4A2ARI4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lgr4A2ARI4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lgr4A2ARI4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Lgr4A2ARI4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lgr4A2ARI4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lgr4A2ARI4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Lgr4A2ARI4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lgr4A2ARI4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lgr4A2ARI4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lgr4A2ARI4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lgr4A2ARI4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lgr4A2ARI4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lgr4A2ARI4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lgr4A2ARI4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Lgr4A2ARI4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lgr4A2ARI4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lgr4A2ARI4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lgr4A2ARI4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Lgr4A2ARI4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lgr4A2ARI4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lgr4A2ARI4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lgr4A2ARI4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lgr4A2ARI4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lgr4A2ARI4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lgr4A2ARI4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lgr4A2ARI4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lgr4A2ARI4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms