Protein–RNA interactions for Protein: A2AM80

Fam43b, Family with sequence similarity 43, member B, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam43bA2AM80 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam43bA2AM80 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam43bA2AM80 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam43bA2AM80 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam43bA2AM80 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam43bA2AM80 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam43bA2AM80 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam43bA2AM80 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam43bA2AM80 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam43bA2AM80 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam43bA2AM80 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam43bA2AM80 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam43bA2AM80 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam43bA2AM80 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam43bA2AM80 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam43bA2AM80 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam43bA2AM80 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam43bA2AM80 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam43bA2AM80 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam43bA2AM80 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam43bA2AM80 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam43bA2AM80 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam43bA2AM80 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam43bA2AM80 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam43bA2AM80 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam43bA2AM80 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam43bA2AM80 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam43bA2AM80 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam43bA2AM80 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam43bA2AM80 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam43bA2AM80 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Fam43bA2AM80 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fam43bA2AM80 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fam43bA2AM80 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fam43bA2AM80 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fam43bA2AM80 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fam43bA2AM80 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam43bA2AM80 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam43bA2AM80 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam43bA2AM80 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam43bA2AM80 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam43bA2AM80 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam43bA2AM80 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam43bA2AM80 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam43bA2AM80 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam43bA2AM80 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam43bA2AM80 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam43bA2AM80 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam43bA2AM80 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam43bA2AM80 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam43bA2AM80 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam43bA2AM80 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam43bA2AM80 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fam43bA2AM80 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam43bA2AM80 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam43bA2AM80 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam43bA2AM80 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam43bA2AM80 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fam43bA2AM80 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fam43bA2AM80 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fam43bA2AM80 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fam43bA2AM80 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fam43bA2AM80 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam43bA2AM80 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam43bA2AM80 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam43bA2AM80 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam43bA2AM80 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam43bA2AM80 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam43bA2AM80 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam43bA2AM80 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fam43bA2AM80 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fam43bA2AM80 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam43bA2AM80 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam43bA2AM80 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam43bA2AM80 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam43bA2AM80 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam43bA2AM80 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam43bA2AM80 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam43bA2AM80 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam43bA2AM80 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam43bA2AM80 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam43bA2AM80 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam43bA2AM80 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam43bA2AM80 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam43bA2AM80 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam43bA2AM80 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam43bA2AM80 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam43bA2AM80 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam43bA2AM80 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam43bA2AM80 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam43bA2AM80 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam43bA2AM80 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam43bA2AM80 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam43bA2AM80 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam43bA2AM80 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam43bA2AM80 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam43bA2AM80 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam43bA2AM80 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam43bA2AM80 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam43bA2AM80 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms