Protein–RNA interactions for Protein: A2AKM2

Hacd4, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 4, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd4A2AKM2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hacd4A2AKM2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hacd4A2AKM2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hacd4A2AKM2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hacd4A2AKM2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hacd4A2AKM2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Hacd4A2AKM2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hacd4A2AKM2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hacd4A2AKM2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hacd4A2AKM2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hacd4A2AKM2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hacd4A2AKM2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hacd4A2AKM2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hacd4A2AKM2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hacd4A2AKM2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Hacd4A2AKM2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hacd4A2AKM2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hacd4A2AKM2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hacd4A2AKM2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Hacd4A2AKM2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hacd4A2AKM2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hacd4A2AKM2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hacd4A2AKM2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hacd4A2AKM2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hacd4A2AKM2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hacd4A2AKM2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hacd4A2AKM2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hacd4A2AKM2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hacd4A2AKM2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hacd4A2AKM2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hacd4A2AKM2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hacd4A2AKM2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hacd4A2AKM2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Hacd4A2AKM2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hacd4A2AKM2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hacd4A2AKM2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hacd4A2AKM2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hacd4A2AKM2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hacd4A2AKM2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hacd4A2AKM2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hacd4A2AKM2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hacd4A2AKM2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hacd4A2AKM2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Hacd4A2AKM2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hacd4A2AKM2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hacd4A2AKM2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hacd4A2AKM2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hacd4A2AKM2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hacd4A2AKM2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hacd4A2AKM2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hacd4A2AKM2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hacd4A2AKM2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hacd4A2AKM2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hacd4A2AKM2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hacd4A2AKM2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hacd4A2AKM2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hacd4A2AKM2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hacd4A2AKM2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hacd4A2AKM2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hacd4A2AKM2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Hacd4A2AKM2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hacd4A2AKM2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hacd4A2AKM2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hacd4A2AKM2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hacd4A2AKM2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hacd4A2AKM2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hacd4A2AKM2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hacd4A2AKM2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hacd4A2AKM2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hacd4A2AKM2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hacd4A2AKM2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hacd4A2AKM2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hacd4A2AKM2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hacd4A2AKM2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hacd4A2AKM2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hacd4A2AKM2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hacd4A2AKM2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hacd4A2AKM2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hacd4A2AKM2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Hacd4A2AKM2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Hacd4A2AKM2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Hacd4A2AKM2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hacd4A2AKM2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hacd4A2AKM2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hacd4A2AKM2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hacd4A2AKM2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hacd4A2AKM2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hacd4A2AKM2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Hacd4A2AKM2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hacd4A2AKM2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hacd4A2AKM2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hacd4A2AKM2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hacd4A2AKM2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hacd4A2AKM2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hacd4A2AKM2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hacd4A2AKM2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hacd4A2AKM2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hacd4A2AKM2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hacd4A2AKM2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hacd4A2AKM2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms