Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ77

Prdm12, PR domain zinc finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm12A2AJ77 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prdm12A2AJ77 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prdm12A2AJ77 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prdm12A2AJ77 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prdm12A2AJ77 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prdm12A2AJ77 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prdm12A2AJ77 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prdm12A2AJ77 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prdm12A2AJ77 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Prdm12A2AJ77 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prdm12A2AJ77 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Prdm12A2AJ77 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prdm12A2AJ77 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prdm12A2AJ77 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prdm12A2AJ77 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prdm12A2AJ77 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prdm12A2AJ77 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prdm12A2AJ77 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prdm12A2AJ77 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prdm12A2AJ77 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prdm12A2AJ77 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prdm12A2AJ77 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prdm12A2AJ77 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prdm12A2AJ77 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prdm12A2AJ77 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prdm12A2AJ77 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prdm12A2AJ77 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prdm12A2AJ77 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prdm12A2AJ77 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prdm12A2AJ77 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prdm12A2AJ77 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prdm12A2AJ77 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prdm12A2AJ77 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prdm12A2AJ77 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prdm12A2AJ77 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Prdm12A2AJ77 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Prdm12A2AJ77 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prdm12A2AJ77 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Prdm12A2AJ77 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prdm12A2AJ77 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prdm12A2AJ77 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prdm12A2AJ77 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prdm12A2AJ77 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prdm12A2AJ77 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Prdm12A2AJ77 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prdm12A2AJ77 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prdm12A2AJ77 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prdm12A2AJ77 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prdm12A2AJ77 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prdm12A2AJ77 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prdm12A2AJ77 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prdm12A2AJ77 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prdm12A2AJ77 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prdm12A2AJ77 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prdm12A2AJ77 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Prdm12A2AJ77 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prdm12A2AJ77 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prdm12A2AJ77 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Prdm12A2AJ77 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prdm12A2AJ77 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prdm12A2AJ77 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prdm12A2AJ77 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prdm12A2AJ77 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prdm12A2AJ77 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prdm12A2AJ77 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prdm12A2AJ77 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prdm12A2AJ77 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prdm12A2AJ77 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prdm12A2AJ77 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prdm12A2AJ77 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prdm12A2AJ77 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prdm12A2AJ77 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prdm12A2AJ77 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prdm12A2AJ77 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prdm12A2AJ77 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prdm12A2AJ77 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prdm12A2AJ77 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prdm12A2AJ77 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prdm12A2AJ77 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prdm12A2AJ77 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prdm12A2AJ77 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prdm12A2AJ77 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prdm12A2AJ77 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prdm12A2AJ77 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prdm12A2AJ77 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prdm12A2AJ77 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prdm12A2AJ77 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prdm12A2AJ77 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Prdm12A2AJ77 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prdm12A2AJ77 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prdm12A2AJ77 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Prdm12A2AJ77 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prdm12A2AJ77 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prdm12A2AJ77 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prdm12A2AJ77 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prdm12A2AJ77 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prdm12A2AJ77 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prdm12A2AJ77 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prdm12A2AJ77 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prdm12A2AJ77 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 230.8 ms