Protein–RNA interactions for Protein: A2A958

C87977, Expressed sequence C87977, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C87977A2A958 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
C87977A2A958 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
C87977A2A958 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
C87977A2A958 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
C87977A2A958 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
C87977A2A958 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
C87977A2A958 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
C87977A2A958 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
C87977A2A958 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
C87977A2A958 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
C87977A2A958 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
C87977A2A958 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
C87977A2A958 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
C87977A2A958 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
C87977A2A958 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
C87977A2A958 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
C87977A2A958 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
C87977A2A958 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
C87977A2A958 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
C87977A2A958 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
C87977A2A958 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
C87977A2A958 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
C87977A2A958 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
C87977A2A958 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
C87977A2A958 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
C87977A2A958 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
C87977A2A958 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
C87977A2A958 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
C87977A2A958 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
C87977A2A958 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
C87977A2A958 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
C87977A2A958 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
C87977A2A958 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
C87977A2A958 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
C87977A2A958 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
C87977A2A958 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
C87977A2A958 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
C87977A2A958 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
C87977A2A958 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
C87977A2A958 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
C87977A2A958 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
C87977A2A958 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
C87977A2A958 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
C87977A2A958 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
C87977A2A958 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
C87977A2A958 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
C87977A2A958 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
C87977A2A958 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
C87977A2A958 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
C87977A2A958 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
C87977A2A958 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
C87977A2A958 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
C87977A2A958 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C87977A2A958 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
C87977A2A958 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
C87977A2A958 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
C87977A2A958 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C87977A2A958 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C87977A2A958 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
C87977A2A958 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
C87977A2A958 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
C87977A2A958 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
C87977A2A958 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
C87977A2A958 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
C87977A2A958 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
C87977A2A958 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C87977A2A958 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C87977A2A958 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C87977A2A958 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
C87977A2A958 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
C87977A2A958 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
C87977A2A958 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C87977A2A958 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
C87977A2A958 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C87977A2A958 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
C87977A2A958 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C87977A2A958 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
C87977A2A958 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
C87977A2A958 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
C87977A2A958 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
C87977A2A958 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
C87977A2A958 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C87977A2A958 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C87977A2A958 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C87977A2A958 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
C87977A2A958 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
C87977A2A958 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
C87977A2A958 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
C87977A2A958 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
C87977A2A958 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
C87977A2A958 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
C87977A2A958 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
C87977A2A958 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
C87977A2A958 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
C87977A2A958 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
C87977A2A958 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
C87977A2A958 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
C87977A2A958 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
C87977A2A958 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
C87977A2A958 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms