Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Prdm16A2A935 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
Prdm16A2A935 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Prdm16A2A935 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Prdm16A2A935 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Prdm16A2A935 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
Prdm16A2A935 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Prdm16A2A935 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
Prdm16A2A935 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Prdm16A2A935 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Prdm16A2A935 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Prdm16A2A935 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Prdm16A2A935 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Prdm16A2A935 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Prdm16A2A935 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Prdm16A2A935 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Prdm16A2A935 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Prdm16A2A935 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Prdm16A2A935 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Prdm16A2A935 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Prdm16A2A935 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Prdm16A2A935 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Prdm16A2A935 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Prdm16A2A935 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Prdm16A2A935 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Prdm16A2A935 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Prdm16A2A935 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Prdm16A2A935 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Prdm16A2A935 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Prdm16A2A935 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Prdm16A2A935 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Prdm16A2A935 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
Prdm16A2A935 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Prdm16A2A935 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
Prdm16A2A935 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC33.81■■■■□ 3
Prdm16A2A935 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
Prdm16A2A935 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Prdm16A2A935 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
Prdm16A2A935 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC33.8■■■■□ 3
Prdm16A2A935 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
Prdm16A2A935 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC33.79■■■■□ 3
Prdm16A2A935 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Prdm16A2A935 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Prdm16A2A935 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Prdm16A2A935 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Prdm16A2A935 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
Prdm16A2A935 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Prdm16A2A935 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Prdm16A2A935 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Prdm16A2A935 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Prdm16A2A935 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Prdm16A2A935 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Prdm16A2A935 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
Prdm16A2A935 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Prdm16A2A935 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Prdm16A2A935 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Prdm16A2A935 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Prdm16A2A935 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Prdm16A2A935 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
Prdm16A2A935 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Prdm16A2A935 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Prdm16A2A935 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Prdm16A2A935 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Prdm16A2A935 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Prdm16A2A935 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Prdm16A2A935 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Prdm16A2A935 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Prdm16A2A935 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Prdm16A2A935 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
Prdm16A2A935 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Prdm16A2A935 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Prdm16A2A935 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Prdm16A2A935 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Prdm16A2A935 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Prdm16A2A935 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
Prdm16A2A935 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Prdm16A2A935 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Prdm16A2A935 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Prdm16A2A935 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Prdm16A2A935 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
Prdm16A2A935 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Prdm16A2A935 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Prdm16A2A935 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Prdm16A2A935 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Prdm16A2A935 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Prdm16A2A935 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
Prdm16A2A935 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Prdm16A2A935 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Prdm16A2A935 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Prdm16A2A935 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
Prdm16A2A935 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Prdm16A2A935 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Prdm16A2A935 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Prdm16A2A935 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Prdm16A2A935 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
Prdm16A2A935 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Prdm16A2A935 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Prdm16A2A935 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Prdm16A2A935 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Prdm16A2A935 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms