Protein–RNA interactions for Protein: A2A6H3

Fbxo47, F-box only protein 47, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo47A2A6H3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fbxo47A2A6H3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fbxo47A2A6H3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fbxo47A2A6H3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fbxo47A2A6H3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Fbxo47A2A6H3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Fbxo47A2A6H3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Fbxo47A2A6H3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fbxo47A2A6H3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Fbxo47A2A6H3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Fbxo47A2A6H3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fbxo47A2A6H3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fbxo47A2A6H3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Fbxo47A2A6H3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Fbxo47A2A6H3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fbxo47A2A6H3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fbxo47A2A6H3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Fbxo47A2A6H3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fbxo47A2A6H3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fbxo47A2A6H3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fbxo47A2A6H3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fbxo47A2A6H3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Fbxo47A2A6H3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fbxo47A2A6H3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fbxo47A2A6H3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fbxo47A2A6H3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fbxo47A2A6H3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fbxo47A2A6H3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fbxo47A2A6H3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fbxo47A2A6H3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fbxo47A2A6H3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fbxo47A2A6H3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fbxo47A2A6H3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Fbxo47A2A6H3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fbxo47A2A6H3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fbxo47A2A6H3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fbxo47A2A6H3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fbxo47A2A6H3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fbxo47A2A6H3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fbxo47A2A6H3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fbxo47A2A6H3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fbxo47A2A6H3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fbxo47A2A6H3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fbxo47A2A6H3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fbxo47A2A6H3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fbxo47A2A6H3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fbxo47A2A6H3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fbxo47A2A6H3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fbxo47A2A6H3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fbxo47A2A6H3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fbxo47A2A6H3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fbxo47A2A6H3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fbxo47A2A6H3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fbxo47A2A6H3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fbxo47A2A6H3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fbxo47A2A6H3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fbxo47A2A6H3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fbxo47A2A6H3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fbxo47A2A6H3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fbxo47A2A6H3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fbxo47A2A6H3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fbxo47A2A6H3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fbxo47A2A6H3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fbxo47A2A6H3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fbxo47A2A6H3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fbxo47A2A6H3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fbxo47A2A6H3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fbxo47A2A6H3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fbxo47A2A6H3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fbxo47A2A6H3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fbxo47A2A6H3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fbxo47A2A6H3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fbxo47A2A6H3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fbxo47A2A6H3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fbxo47A2A6H3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fbxo47A2A6H3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fbxo47A2A6H3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fbxo47A2A6H3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fbxo47A2A6H3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fbxo47A2A6H3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Fbxo47A2A6H3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fbxo47A2A6H3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fbxo47A2A6H3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fbxo47A2A6H3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fbxo47A2A6H3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fbxo47A2A6H3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fbxo47A2A6H3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fbxo47A2A6H3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fbxo47A2A6H3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fbxo47A2A6H3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fbxo47A2A6H3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fbxo47A2A6H3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Fbxo47A2A6H3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fbxo47A2A6H3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fbxo47A2A6H3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fbxo47A2A6H3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fbxo47A2A6H3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fbxo47A2A6H3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fbxo47A2A6H3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fbxo47A2A6H3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms