Protein–RNA interactions for Protein: A2A4P4

Gm27029, Predicted gene, 27029, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm27029A2A4P4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm27029A2A4P4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm27029A2A4P4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm27029A2A4P4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gm27029A2A4P4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm27029A2A4P4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm27029A2A4P4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm27029A2A4P4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm27029A2A4P4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm27029A2A4P4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm27029A2A4P4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm27029A2A4P4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm27029A2A4P4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm27029A2A4P4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm27029A2A4P4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm27029A2A4P4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm27029A2A4P4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm27029A2A4P4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm27029A2A4P4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm27029A2A4P4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm27029A2A4P4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm27029A2A4P4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm27029A2A4P4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm27029A2A4P4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm27029A2A4P4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm27029A2A4P4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm27029A2A4P4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Gm27029A2A4P4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm27029A2A4P4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm27029A2A4P4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm27029A2A4P4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm27029A2A4P4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm27029A2A4P4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm27029A2A4P4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm27029A2A4P4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm27029A2A4P4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm27029A2A4P4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm27029A2A4P4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm27029A2A4P4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm27029A2A4P4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm27029A2A4P4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm27029A2A4P4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm27029A2A4P4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm27029A2A4P4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm27029A2A4P4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm27029A2A4P4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm27029A2A4P4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm27029A2A4P4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm27029A2A4P4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm27029A2A4P4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm27029A2A4P4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm27029A2A4P4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm27029A2A4P4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm27029A2A4P4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm27029A2A4P4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm27029A2A4P4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm27029A2A4P4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm27029A2A4P4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm27029A2A4P4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm27029A2A4P4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm27029A2A4P4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm27029A2A4P4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm27029A2A4P4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm27029A2A4P4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm27029A2A4P4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm27029A2A4P4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm27029A2A4P4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm27029A2A4P4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm27029A2A4P4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm27029A2A4P4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm27029A2A4P4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gm27029A2A4P4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gm27029A2A4P4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gm27029A2A4P4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gm27029A2A4P4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm27029A2A4P4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm27029A2A4P4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm27029A2A4P4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm27029A2A4P4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm27029A2A4P4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm27029A2A4P4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm27029A2A4P4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm27029A2A4P4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm27029A2A4P4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm27029A2A4P4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm27029A2A4P4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm27029A2A4P4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm27029A2A4P4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm27029A2A4P4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm27029A2A4P4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm27029A2A4P4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm27029A2A4P4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm27029A2A4P4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm27029A2A4P4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm27029A2A4P4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm27029A2A4P4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm27029A2A4P4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm27029A2A4P4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm27029A2A4P4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm27029A2A4P4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms