Protein–RNA interactions for Protein: A1EGX6

Fscb, Fibrous sheath CABYR-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FscbA1EGX6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FscbA1EGX6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FscbA1EGX6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FscbA1EGX6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FscbA1EGX6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FscbA1EGX6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FscbA1EGX6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FscbA1EGX6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FscbA1EGX6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FscbA1EGX6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FscbA1EGX6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FscbA1EGX6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FscbA1EGX6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FscbA1EGX6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FscbA1EGX6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FscbA1EGX6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FscbA1EGX6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FscbA1EGX6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FscbA1EGX6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
FscbA1EGX6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FscbA1EGX6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FscbA1EGX6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FscbA1EGX6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FscbA1EGX6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FscbA1EGX6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FscbA1EGX6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FscbA1EGX6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FscbA1EGX6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FscbA1EGX6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FscbA1EGX6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FscbA1EGX6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FscbA1EGX6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FscbA1EGX6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FscbA1EGX6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FscbA1EGX6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FscbA1EGX6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FscbA1EGX6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FscbA1EGX6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
FscbA1EGX6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FscbA1EGX6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FscbA1EGX6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FscbA1EGX6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FscbA1EGX6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FscbA1EGX6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FscbA1EGX6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FscbA1EGX6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FscbA1EGX6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FscbA1EGX6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FscbA1EGX6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FscbA1EGX6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FscbA1EGX6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FscbA1EGX6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FscbA1EGX6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FscbA1EGX6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FscbA1EGX6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FscbA1EGX6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FscbA1EGX6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FscbA1EGX6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FscbA1EGX6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FscbA1EGX6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FscbA1EGX6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FscbA1EGX6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FscbA1EGX6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
FscbA1EGX6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FscbA1EGX6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FscbA1EGX6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FscbA1EGX6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FscbA1EGX6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FscbA1EGX6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FscbA1EGX6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FscbA1EGX6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FscbA1EGX6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FscbA1EGX6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FscbA1EGX6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FscbA1EGX6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FscbA1EGX6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FscbA1EGX6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FscbA1EGX6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FscbA1EGX6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FscbA1EGX6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FscbA1EGX6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FscbA1EGX6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FscbA1EGX6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FscbA1EGX6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FscbA1EGX6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FscbA1EGX6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FscbA1EGX6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FscbA1EGX6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FscbA1EGX6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FscbA1EGX6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FscbA1EGX6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FscbA1EGX6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FscbA1EGX6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FscbA1EGX6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FscbA1EGX6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FscbA1EGX6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FscbA1EGX6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FscbA1EGX6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FscbA1EGX6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FscbA1EGX6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms