Protein–RNA interactions for Protein: A0AUP1

Ccdc112, Coiled-coil domain-containing protein 112, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc112A0AUP1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc112A0AUP1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc112A0AUP1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc112A0AUP1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc112A0AUP1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc112A0AUP1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc112A0AUP1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc112A0AUP1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc112A0AUP1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc112A0AUP1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc112A0AUP1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc112A0AUP1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc112A0AUP1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc112A0AUP1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc112A0AUP1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc112A0AUP1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc112A0AUP1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc112A0AUP1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc112A0AUP1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc112A0AUP1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc112A0AUP1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc112A0AUP1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc112A0AUP1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc112A0AUP1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc112A0AUP1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc112A0AUP1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc112A0AUP1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc112A0AUP1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc112A0AUP1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc112A0AUP1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc112A0AUP1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc112A0AUP1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc112A0AUP1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc112A0AUP1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc112A0AUP1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc112A0AUP1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc112A0AUP1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc112A0AUP1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ccdc112A0AUP1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc112A0AUP1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc112A0AUP1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc112A0AUP1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc112A0AUP1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc112A0AUP1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc112A0AUP1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc112A0AUP1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc112A0AUP1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc112A0AUP1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc112A0AUP1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc112A0AUP1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc112A0AUP1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc112A0AUP1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc112A0AUP1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc112A0AUP1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc112A0AUP1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc112A0AUP1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc112A0AUP1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc112A0AUP1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc112A0AUP1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc112A0AUP1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc112A0AUP1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc112A0AUP1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc112A0AUP1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc112A0AUP1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc112A0AUP1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc112A0AUP1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc112A0AUP1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc112A0AUP1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc112A0AUP1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc112A0AUP1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc112A0AUP1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc112A0AUP1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc112A0AUP1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc112A0AUP1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc112A0AUP1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc112A0AUP1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc112A0AUP1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc112A0AUP1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc112A0AUP1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc112A0AUP1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc112A0AUP1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc112A0AUP1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc112A0AUP1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc112A0AUP1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc112A0AUP1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc112A0AUP1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc112A0AUP1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc112A0AUP1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc112A0AUP1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Ccdc112A0AUP1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc112A0AUP1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc112A0AUP1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc112A0AUP1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc112A0AUP1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc112A0AUP1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc112A0AUP1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc112A0AUP1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc112A0AUP1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc112A0AUP1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc112A0AUP1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms