Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LHF2

Vsig10l2, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 10-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsig10l2A0A140LHF2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vsig10l2A0A140LHF2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vsig10l2A0A140LHF2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Vsig10l2A0A140LHF2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Vsig10l2A0A140LHF2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Vsig10l2A0A140LHF2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vsig10l2A0A140LHF2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vsig10l2A0A140LHF2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vsig10l2A0A140LHF2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Vsig10l2A0A140LHF2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vsig10l2A0A140LHF2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vsig10l2A0A140LHF2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vsig10l2A0A140LHF2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vsig10l2A0A140LHF2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vsig10l2A0A140LHF2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vsig10l2A0A140LHF2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vsig10l2A0A140LHF2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vsig10l2A0A140LHF2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vsig10l2A0A140LHF2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vsig10l2A0A140LHF2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vsig10l2A0A140LHF2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vsig10l2A0A140LHF2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vsig10l2A0A140LHF2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vsig10l2A0A140LHF2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vsig10l2A0A140LHF2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vsig10l2A0A140LHF2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vsig10l2A0A140LHF2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Vsig10l2A0A140LHF2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vsig10l2A0A140LHF2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Vsig10l2A0A140LHF2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Vsig10l2A0A140LHF2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Vsig10l2A0A140LHF2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vsig10l2A0A140LHF2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vsig10l2A0A140LHF2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vsig10l2A0A140LHF2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vsig10l2A0A140LHF2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vsig10l2A0A140LHF2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vsig10l2A0A140LHF2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vsig10l2A0A140LHF2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vsig10l2A0A140LHF2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vsig10l2A0A140LHF2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vsig10l2A0A140LHF2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vsig10l2A0A140LHF2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vsig10l2A0A140LHF2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vsig10l2A0A140LHF2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vsig10l2A0A140LHF2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vsig10l2A0A140LHF2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vsig10l2A0A140LHF2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vsig10l2A0A140LHF2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vsig10l2A0A140LHF2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vsig10l2A0A140LHF2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vsig10l2A0A140LHF2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vsig10l2A0A140LHF2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vsig10l2A0A140LHF2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vsig10l2A0A140LHF2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vsig10l2A0A140LHF2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vsig10l2A0A140LHF2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vsig10l2A0A140LHF2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vsig10l2A0A140LHF2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vsig10l2A0A140LHF2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vsig10l2A0A140LHF2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vsig10l2A0A140LHF2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vsig10l2A0A140LHF2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vsig10l2A0A140LHF2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vsig10l2A0A140LHF2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vsig10l2A0A140LHF2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vsig10l2A0A140LHF2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vsig10l2A0A140LHF2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vsig10l2A0A140LHF2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vsig10l2A0A140LHF2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vsig10l2A0A140LHF2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vsig10l2A0A140LHF2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vsig10l2A0A140LHF2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vsig10l2A0A140LHF2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Vsig10l2A0A140LHF2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vsig10l2A0A140LHF2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vsig10l2A0A140LHF2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vsig10l2A0A140LHF2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vsig10l2A0A140LHF2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vsig10l2A0A140LHF2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Vsig10l2A0A140LHF2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vsig10l2A0A140LHF2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vsig10l2A0A140LHF2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vsig10l2A0A140LHF2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vsig10l2A0A140LHF2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vsig10l2A0A140LHF2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vsig10l2A0A140LHF2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vsig10l2A0A140LHF2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vsig10l2A0A140LHF2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vsig10l2A0A140LHF2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vsig10l2A0A140LHF2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vsig10l2A0A140LHF2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vsig10l2A0A140LHF2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vsig10l2A0A140LHF2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vsig10l2A0A140LHF2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vsig10l2A0A140LHF2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Vsig10l2A0A140LHF2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vsig10l2A0A140LHF2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vsig10l2A0A140LHF2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vsig10l2A0A140LHF2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms