Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YX06

Trbv21, T cell receptor beta, variable 21 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv21A0A0A6YX06 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trbv21A0A0A6YX06 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trbv21A0A0A6YX06 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trbv21A0A0A6YX06 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trbv21A0A0A6YX06 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trbv21A0A0A6YX06 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Trbv21A0A0A6YX06 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trbv21A0A0A6YX06 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trbv21A0A0A6YX06 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trbv21A0A0A6YX06 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trbv21A0A0A6YX06 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trbv21A0A0A6YX06 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trbv21A0A0A6YX06 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trbv21A0A0A6YX06 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trbv21A0A0A6YX06 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trbv21A0A0A6YX06 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trbv21A0A0A6YX06 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Trbv21A0A0A6YX06 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Trbv21A0A0A6YX06 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trbv21A0A0A6YX06 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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Trbv21A0A0A6YX06 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trbv21A0A0A6YX06 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trbv21A0A0A6YX06 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trbv21A0A0A6YX06 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trbv21A0A0A6YX06 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
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Trbv21A0A0A6YX06 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trbv21A0A0A6YX06 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trbv21A0A0A6YX06 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trbv21A0A0A6YX06 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trbv21A0A0A6YX06 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trbv21A0A0A6YX06 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trbv21A0A0A6YX06 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trbv21A0A0A6YX06 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trbv21A0A0A6YX06 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trbv21A0A0A6YX06 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trbv21A0A0A6YX06 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
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Trbv21A0A0A6YX06 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trbv21A0A0A6YX06 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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Trbv21A0A0A6YX06 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trbv21A0A0A6YX06 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
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Trbv21A0A0A6YX06 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
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Trbv21A0A0A6YX06 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
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Trbv21A0A0A6YX06 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trbv21A0A0A6YX06 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trbv21A0A0A6YX06 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trbv21A0A0A6YX06 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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Trbv21A0A0A6YX06 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trbv21A0A0A6YX06 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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Trbv21A0A0A6YX06 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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Trbv21A0A0A6YX06 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
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Trbv21A0A0A6YX06 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
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Trbv21A0A0A6YX06 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trbv21A0A0A6YX06 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trbv21A0A0A6YX06 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trbv21A0A0A6YX06 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trbv21A0A0A6YX06 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trbv21A0A0A6YX06 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Trbv21A0A0A6YX06 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trbv21A0A0A6YX06 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trbv21A0A0A6YX06 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trbv21A0A0A6YX06 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trbv21A0A0A6YX06 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trbv21A0A0A6YX06 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trbv21A0A0A6YX06 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trbv21A0A0A6YX06 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
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Trbv21A0A0A6YX06 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trbv21A0A0A6YX06 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trbv21A0A0A6YX06 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trbv21A0A0A6YX06 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trbv21A0A0A6YX06 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
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Trbv21A0A0A6YX06 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
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