Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5J4

Trbc2, T cell receptor beta, constant 2 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbc2A0A075B5J4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trbc2A0A075B5J4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trbc2A0A075B5J4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Trbc2A0A075B5J4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trbc2A0A075B5J4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trbc2A0A075B5J4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trbc2A0A075B5J4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trbc2A0A075B5J4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trbc2A0A075B5J4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trbc2A0A075B5J4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Trbc2A0A075B5J4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Trbc2A0A075B5J4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trbc2A0A075B5J4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trbc2A0A075B5J4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trbc2A0A075B5J4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trbc2A0A075B5J4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trbc2A0A075B5J4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trbc2A0A075B5J4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trbc2A0A075B5J4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trbc2A0A075B5J4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trbc2A0A075B5J4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trbc2A0A075B5J4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trbc2A0A075B5J4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trbc2A0A075B5J4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trbc2A0A075B5J4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trbc2A0A075B5J4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trbc2A0A075B5J4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trbc2A0A075B5J4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trbc2A0A075B5J4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trbc2A0A075B5J4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trbc2A0A075B5J4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trbc2A0A075B5J4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trbc2A0A075B5J4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trbc2A0A075B5J4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trbc2A0A075B5J4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trbc2A0A075B5J4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Trbc2A0A075B5J4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trbc2A0A075B5J4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trbc2A0A075B5J4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trbc2A0A075B5J4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trbc2A0A075B5J4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trbc2A0A075B5J4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trbc2A0A075B5J4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trbc2A0A075B5J4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trbc2A0A075B5J4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trbc2A0A075B5J4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trbc2A0A075B5J4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trbc2A0A075B5J4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Trbc2A0A075B5J4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trbc2A0A075B5J4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trbc2A0A075B5J4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trbc2A0A075B5J4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Trbc2A0A075B5J4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trbc2A0A075B5J4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trbc2A0A075B5J4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trbc2A0A075B5J4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trbc2A0A075B5J4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trbc2A0A075B5J4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trbc2A0A075B5J4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trbc2A0A075B5J4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trbc2A0A075B5J4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trbc2A0A075B5J4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trbc2A0A075B5J4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trbc2A0A075B5J4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trbc2A0A075B5J4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trbc2A0A075B5J4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trbc2A0A075B5J4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trbc2A0A075B5J4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trbc2A0A075B5J4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trbc2A0A075B5J4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trbc2A0A075B5J4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trbc2A0A075B5J4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trbc2A0A075B5J4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trbc2A0A075B5J4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trbc2A0A075B5J4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trbc2A0A075B5J4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trbc2A0A075B5J4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trbc2A0A075B5J4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trbc2A0A075B5J4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trbc2A0A075B5J4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trbc2A0A075B5J4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trbc2A0A075B5J4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Trbc2A0A075B5J4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Trbc2A0A075B5J4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Trbc2A0A075B5J4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trbc2A0A075B5J4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trbc2A0A075B5J4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trbc2A0A075B5J4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trbc2A0A075B5J4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Trbc2A0A075B5J4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trbc2A0A075B5J4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trbc2A0A075B5J4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trbc2A0A075B5J4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trbc2A0A075B5J4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trbc2A0A075B5J4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trbc2A0A075B5J4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trbc2A0A075B5J4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trbc2A0A075B5J4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trbc2A0A075B5J4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trbc2A0A075B5J4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
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