Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK54

Msgn1, Mesogenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msgn1Q9JK54 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Msgn1Q9JK54 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Msgn1Q9JK54 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Msgn1Q9JK54 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Msgn1Q9JK54 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Msgn1Q9JK54 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Msgn1Q9JK54 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Msgn1Q9JK54 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Msgn1Q9JK54 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Msgn1Q9JK54 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Msgn1Q9JK54 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Msgn1Q9JK54 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Msgn1Q9JK54 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Msgn1Q9JK54 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Msgn1Q9JK54 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Msgn1Q9JK54 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Msgn1Q9JK54 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Msgn1Q9JK54 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Msgn1Q9JK54 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Msgn1Q9JK54 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Msgn1Q9JK54 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Msgn1Q9JK54 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Msgn1Q9JK54 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Msgn1Q9JK54 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Msgn1Q9JK54 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msgn1Q9JK54 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms