Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rpgrip1Q9EPQ2 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rpgrip1Q9EPQ2 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rpgrip1Q9EPQ2 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rpgrip1Q9EPQ2 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rpgrip1Q9EPQ2 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rpgrip1Q9EPQ2 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms