Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB3

MNCb-2875, Putative uncharacterized protein FLJ38447 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MNCb-2875Q9DCB3 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MNCb-2875Q9DCB3 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MNCb-2875Q9DCB3 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MNCb-2875Q9DCB3 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MNCb-2875Q9DCB3 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MNCb-2875Q9DCB3 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MNCb-2875Q9DCB3 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
MNCb-2875Q9DCB3 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
MNCb-2875Q9DCB3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MNCb-2875Q9DCB3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MNCb-2875Q9DCB3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MNCb-2875Q9DCB3 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MNCb-2875Q9DCB3 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MNCb-2875Q9DCB3 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
MNCb-2875Q9DCB3 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MNCb-2875Q9DCB3 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MNCb-2875Q9DCB3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
MNCb-2875Q9DCB3 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
MNCb-2875Q9DCB3 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MNCb-2875Q9DCB3 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MNCb-2875Q9DCB3 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MNCb-2875Q9DCB3 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MNCb-2875Q9DCB3 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MNCb-2875Q9DCB3 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MNCb-2875Q9DCB3 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
MNCb-2875Q9DCB3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MNCb-2875Q9DCB3 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MNCb-2875Q9DCB3 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
MNCb-2875Q9DCB3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
MNCb-2875Q9DCB3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MNCb-2875Q9DCB3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MNCb-2875Q9DCB3 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MNCb-2875Q9DCB3 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MNCb-2875Q9DCB3 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MNCb-2875Q9DCB3 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
MNCb-2875Q9DCB3 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MNCb-2875Q9DCB3 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MNCb-2875Q9DCB3 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MNCb-2875Q9DCB3 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MNCb-2875Q9DCB3 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MNCb-2875Q9DCB3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MNCb-2875Q9DCB3 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MNCb-2875Q9DCB3 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MNCb-2875Q9DCB3 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MNCb-2875Q9DCB3 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
MNCb-2875Q9DCB3 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
MNCb-2875Q9DCB3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
MNCb-2875Q9DCB3 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
MNCb-2875Q9DCB3 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
MNCb-2875Q9DCB3 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
MNCb-2875Q9DCB3 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
MNCb-2875Q9DCB3 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
MNCb-2875Q9DCB3 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
MNCb-2875Q9DCB3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
MNCb-2875Q9DCB3 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
MNCb-2875Q9DCB3 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
MNCb-2875Q9DCB3 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
MNCb-2875Q9DCB3 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
MNCb-2875Q9DCB3 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
MNCb-2875Q9DCB3 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
MNCb-2875Q9DCB3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
MNCb-2875Q9DCB3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
MNCb-2875Q9DCB3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
MNCb-2875Q9DCB3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
MNCb-2875Q9DCB3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
MNCb-2875Q9DCB3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
MNCb-2875Q9DCB3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
MNCb-2875Q9DCB3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
MNCb-2875Q9DCB3 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
MNCb-2875Q9DCB3 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
MNCb-2875Q9DCB3 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
MNCb-2875Q9DCB3 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
MNCb-2875Q9DCB3 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
MNCb-2875Q9DCB3 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
MNCb-2875Q9DCB3 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
MNCb-2875Q9DCB3 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
MNCb-2875Q9DCB3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
MNCb-2875Q9DCB3 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
MNCb-2875Q9DCB3 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
MNCb-2875Q9DCB3 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
MNCb-2875Q9DCB3 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MNCb-2875Q9DCB3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MNCb-2875Q9DCB3 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MNCb-2875Q9DCB3 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
MNCb-2875Q9DCB3 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
MNCb-2875Q9DCB3 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MNCb-2875Q9DCB3 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MNCb-2875Q9DCB3 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MNCb-2875Q9DCB3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MNCb-2875Q9DCB3 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MNCb-2875Q9DCB3 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MNCb-2875Q9DCB3 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
MNCb-2875Q9DCB3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MNCb-2875Q9DCB3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MNCb-2875Q9DCB3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
MNCb-2875Q9DCB3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MNCb-2875Q9DCB3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MNCb-2875Q9DCB3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
MNCb-2875Q9DCB3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MNCb-2875Q9DCB3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms