Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms