Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU6

Bombesin receptor-activated protein C6orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99KU6 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q99KU6 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q99KU6 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q99KU6 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q99KU6 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q99KU6 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q99KU6 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q99KU6 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q99KU6 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q99KU6 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q99KU6 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q99KU6 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q99KU6 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q99KU6 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q99KU6 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q99KU6 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q99KU6 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q99KU6 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q99KU6 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q99KU6 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q99KU6 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q99KU6 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q99KU6 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q99KU6 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Q99KU6 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q99KU6 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q99KU6 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Q99KU6 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q99KU6 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q99KU6 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q99KU6 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q99KU6 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q99KU6 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q99KU6 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q99KU6 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q99KU6 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q99KU6 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q99KU6 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q99KU6 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q99KU6 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q99KU6 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q99KU6 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q99KU6 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q99KU6 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q99KU6 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q99KU6 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q99KU6 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q99KU6 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q99KU6 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q99KU6 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q99KU6 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q99KU6 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q99KU6 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Q99KU6 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q99KU6 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q99KU6 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Q99KU6 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Q99KU6 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q99KU6 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Q99KU6 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q99KU6 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q99KU6 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q99KU6 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q99KU6 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Q99KU6 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q99KU6 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q99KU6 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q99KU6 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q99KU6 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q99KU6 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q99KU6 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q99KU6 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q99KU6 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q99KU6 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q99KU6 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q99KU6 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q99KU6 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q99KU6 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q99KU6 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q99KU6 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q99KU6 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q99KU6 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q99KU6 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q99KU6 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Q99KU6 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q99KU6 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q99KU6 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q99KU6 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q99KU6 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q99KU6 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q99KU6 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q99KU6 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q99KU6 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q99KU6 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q99KU6 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q99KU6 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q99KU6 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q99KU6 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q99KU6 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q99KU6 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms