Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms