Protein–RNA interactions for Protein: Q8K296

Mtmr3, Myotubularin-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr3Q8K296 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mtmr3Q8K296 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mtmr3Q8K296 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mtmr3Q8K296 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mtmr3Q8K296 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mtmr3Q8K296 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mtmr3Q8K296 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mtmr3Q8K296 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mtmr3Q8K296 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mtmr3Q8K296 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mtmr3Q8K296 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mtmr3Q8K296 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mtmr3Q8K296 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mtmr3Q8K296 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mtmr3Q8K296 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mtmr3Q8K296 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Mtmr3Q8K296 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mtmr3Q8K296 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Mtmr3Q8K296 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mtmr3Q8K296 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mtmr3Q8K296 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mtmr3Q8K296 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mtmr3Q8K296 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mtmr3Q8K296 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mtmr3Q8K296 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mtmr3Q8K296 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mtmr3Q8K296 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mtmr3Q8K296 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mtmr3Q8K296 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mtmr3Q8K296 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mtmr3Q8K296 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mtmr3Q8K296 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mtmr3Q8K296 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mtmr3Q8K296 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mtmr3Q8K296 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mtmr3Q8K296 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mtmr3Q8K296 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mtmr3Q8K296 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mtmr3Q8K296 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mtmr3Q8K296 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mtmr3Q8K296 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mtmr3Q8K296 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Mtmr3Q8K296 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mtmr3Q8K296 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mtmr3Q8K296 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mtmr3Q8K296 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mtmr3Q8K296 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mtmr3Q8K296 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mtmr3Q8K296 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mtmr3Q8K296 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mtmr3Q8K296 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mtmr3Q8K296 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mtmr3Q8K296 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mtmr3Q8K296 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mtmr3Q8K296 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mtmr3Q8K296 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mtmr3Q8K296 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mtmr3Q8K296 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mtmr3Q8K296 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mtmr3Q8K296 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mtmr3Q8K296 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mtmr3Q8K296 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mtmr3Q8K296 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mtmr3Q8K296 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mtmr3Q8K296 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mtmr3Q8K296 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mtmr3Q8K296 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mtmr3Q8K296 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mtmr3Q8K296 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mtmr3Q8K296 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mtmr3Q8K296 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mtmr3Q8K296 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mtmr3Q8K296 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mtmr3Q8K296 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mtmr3Q8K296 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mtmr3Q8K296 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mtmr3Q8K296 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mtmr3Q8K296 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mtmr3Q8K296 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mtmr3Q8K296 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mtmr3Q8K296 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Mtmr3Q8K296 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mtmr3Q8K296 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mtmr3Q8K296 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mtmr3Q8K296 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mtmr3Q8K296 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mtmr3Q8K296 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mtmr3Q8K296 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mtmr3Q8K296 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mtmr3Q8K296 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mtmr3Q8K296 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mtmr3Q8K296 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mtmr3Q8K296 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mtmr3Q8K296 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mtmr3Q8K296 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mtmr3Q8K296 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mtmr3Q8K296 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mtmr3Q8K296 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mtmr3Q8K296 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mtmr3Q8K296 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms