Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFS6

Cpped1, Serine/threonine-protein phosphatase CPPED1, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpped1Q8BFS6 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpped1Q8BFS6 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpped1Q8BFS6 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpped1Q8BFS6 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpped1Q8BFS6 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpped1Q8BFS6 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpped1Q8BFS6 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpped1Q8BFS6 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpped1Q8BFS6 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpped1Q8BFS6 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpped1Q8BFS6 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpped1Q8BFS6 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpped1Q8BFS6 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpped1Q8BFS6 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpped1Q8BFS6 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpped1Q8BFS6 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpped1Q8BFS6 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpped1Q8BFS6 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpped1Q8BFS6 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpped1Q8BFS6 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpped1Q8BFS6 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpped1Q8BFS6 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpped1Q8BFS6 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpped1Q8BFS6 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpped1Q8BFS6 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpped1Q8BFS6 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpped1Q8BFS6 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpped1Q8BFS6 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpped1Q8BFS6 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpped1Q8BFS6 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpped1Q8BFS6 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpped1Q8BFS6 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpped1Q8BFS6 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpped1Q8BFS6 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpped1Q8BFS6 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpped1Q8BFS6 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpped1Q8BFS6 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpped1Q8BFS6 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpped1Q8BFS6 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpped1Q8BFS6 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpped1Q8BFS6 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpped1Q8BFS6 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpped1Q8BFS6 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpped1Q8BFS6 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpped1Q8BFS6 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpped1Q8BFS6 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpped1Q8BFS6 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpped1Q8BFS6 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpped1Q8BFS6 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpped1Q8BFS6 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpped1Q8BFS6 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpped1Q8BFS6 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpped1Q8BFS6 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpped1Q8BFS6 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpped1Q8BFS6 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpped1Q8BFS6 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpped1Q8BFS6 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpped1Q8BFS6 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpped1Q8BFS6 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpped1Q8BFS6 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpped1Q8BFS6 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpped1Q8BFS6 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpped1Q8BFS6 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpped1Q8BFS6 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpped1Q8BFS6 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpped1Q8BFS6 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpped1Q8BFS6 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpped1Q8BFS6 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpped1Q8BFS6 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpped1Q8BFS6 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpped1Q8BFS6 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpped1Q8BFS6 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpped1Q8BFS6 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpped1Q8BFS6 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpped1Q8BFS6 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpped1Q8BFS6 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpped1Q8BFS6 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpped1Q8BFS6 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpped1Q8BFS6 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpped1Q8BFS6 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpped1Q8BFS6 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpped1Q8BFS6 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpped1Q8BFS6 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpped1Q8BFS6 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpped1Q8BFS6 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpped1Q8BFS6 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpped1Q8BFS6 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpped1Q8BFS6 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpped1Q8BFS6 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpped1Q8BFS6 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpped1Q8BFS6 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpped1Q8BFS6 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpped1Q8BFS6 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpped1Q8BFS6 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpped1Q8BFS6 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpped1Q8BFS6 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpped1Q8BFS6 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpped1Q8BFS6 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpped1Q8BFS6 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpped1Q8BFS6 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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