Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc1Q80VQ1 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc1Q80VQ1 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc1Q80VQ1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc1Q80VQ1 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc1Q80VQ1 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc1Q80VQ1 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc1Q80VQ1 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc1Q80VQ1 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc1Q80VQ1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc1Q80VQ1 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc1Q80VQ1 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc1Q80VQ1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc1Q80VQ1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc1Q80VQ1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc1Q80VQ1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc1Q80VQ1 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc1Q80VQ1 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc1Q80VQ1 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc1Q80VQ1 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc1Q80VQ1 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc1Q80VQ1 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc1Q80VQ1 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc1Q80VQ1 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc1Q80VQ1 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc1Q80VQ1 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc1Q80VQ1 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc1Q80VQ1 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc1Q80VQ1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc1Q80VQ1 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc1Q80VQ1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc1Q80VQ1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc1Q80VQ1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc1Q80VQ1 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc1Q80VQ1 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc1Q80VQ1 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc1Q80VQ1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc1Q80VQ1 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc1Q80VQ1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc1Q80VQ1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc1Q80VQ1 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc1Q80VQ1 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc1Q80VQ1 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc1Q80VQ1 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc1Q80VQ1 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc1Q80VQ1 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc1Q80VQ1 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc1Q80VQ1 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc1Q80VQ1 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc1Q80VQ1 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc1Q80VQ1 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc1Q80VQ1 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc1Q80VQ1 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc1Q80VQ1 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc1Q80VQ1 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc1Q80VQ1 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc1Q80VQ1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc1Q80VQ1 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc1Q80VQ1 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc1Q80VQ1 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc1Q80VQ1 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc1Q80VQ1 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc1Q80VQ1 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc1Q80VQ1 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc1Q80VQ1 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc1Q80VQ1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc1Q80VQ1 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc1Q80VQ1 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc1Q80VQ1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc1Q80VQ1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc1Q80VQ1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc1Q80VQ1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc1Q80VQ1 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc1Q80VQ1 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc1Q80VQ1 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc1Q80VQ1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc1Q80VQ1 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc1Q80VQ1 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc1Q80VQ1 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc1Q80VQ1 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc1Q80VQ1 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc1Q80VQ1 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc1Q80VQ1 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc1Q80VQ1 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc1Q80VQ1 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc1Q80VQ1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc1Q80VQ1 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc1Q80VQ1 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc1Q80VQ1 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc1Q80VQ1 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc1Q80VQ1 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc1Q80VQ1 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc1Q80VQ1 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc1Q80VQ1 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc1Q80VQ1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc1Q80VQ1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc1Q80VQ1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc1Q80VQ1 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc1Q80VQ1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc1Q80VQ1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms