Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMD7

Dsg4, Desmoglein-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,041 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg4Q7TMD7 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dsg4Q7TMD7 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dsg4Q7TMD7 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dsg4Q7TMD7 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dsg4Q7TMD7 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dsg4Q7TMD7 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dsg4Q7TMD7 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dsg4Q7TMD7 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Dsg4Q7TMD7 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dsg4Q7TMD7 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Dsg4Q7TMD7 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dsg4Q7TMD7 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dsg4Q7TMD7 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dsg4Q7TMD7 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dsg4Q7TMD7 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dsg4Q7TMD7 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dsg4Q7TMD7 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dsg4Q7TMD7 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dsg4Q7TMD7 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dsg4Q7TMD7 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dsg4Q7TMD7 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dsg4Q7TMD7 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dsg4Q7TMD7 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dsg4Q7TMD7 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dsg4Q7TMD7 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dsg4Q7TMD7 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dsg4Q7TMD7 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dsg4Q7TMD7 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Dsg4Q7TMD7 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dsg4Q7TMD7 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dsg4Q7TMD7 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dsg4Q7TMD7 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dsg4Q7TMD7 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dsg4Q7TMD7 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dsg4Q7TMD7 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Dsg4Q7TMD7 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dsg4Q7TMD7 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dsg4Q7TMD7 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Dsg4Q7TMD7 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dsg4Q7TMD7 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dsg4Q7TMD7 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dsg4Q7TMD7 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dsg4Q7TMD7 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dsg4Q7TMD7 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dsg4Q7TMD7 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dsg4Q7TMD7 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dsg4Q7TMD7 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dsg4Q7TMD7 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dsg4Q7TMD7 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dsg4Q7TMD7 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dsg4Q7TMD7 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dsg4Q7TMD7 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dsg4Q7TMD7 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dsg4Q7TMD7 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dsg4Q7TMD7 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dsg4Q7TMD7 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dsg4Q7TMD7 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dsg4Q7TMD7 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dsg4Q7TMD7 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dsg4Q7TMD7 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dsg4Q7TMD7 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dsg4Q7TMD7 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dsg4Q7TMD7 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dsg4Q7TMD7 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dsg4Q7TMD7 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dsg4Q7TMD7 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dsg4Q7TMD7 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dsg4Q7TMD7 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dsg4Q7TMD7 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dsg4Q7TMD7 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dsg4Q7TMD7 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dsg4Q7TMD7 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dsg4Q7TMD7 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dsg4Q7TMD7 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dsg4Q7TMD7 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dsg4Q7TMD7 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dsg4Q7TMD7 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dsg4Q7TMD7 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dsg4Q7TMD7 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dsg4Q7TMD7 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dsg4Q7TMD7 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dsg4Q7TMD7 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dsg4Q7TMD7 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dsg4Q7TMD7 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dsg4Q7TMD7 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dsg4Q7TMD7 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dsg4Q7TMD7 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dsg4Q7TMD7 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dsg4Q7TMD7 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dsg4Q7TMD7 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dsg4Q7TMD7 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dsg4Q7TMD7 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dsg4Q7TMD7 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dsg4Q7TMD7 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dsg4Q7TMD7 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dsg4Q7TMD7 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dsg4Q7TMD7 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dsg4Q7TMD7 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dsg4Q7TMD7 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dsg4Q7TMD7 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms