Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rad54bQ6PFE3 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rad54bQ6PFE3 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rad54bQ6PFE3 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rad54bQ6PFE3 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rad54bQ6PFE3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rad54bQ6PFE3 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rad54bQ6PFE3 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rad54bQ6PFE3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rad54bQ6PFE3 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rad54bQ6PFE3 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rad54bQ6PFE3 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rad54bQ6PFE3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rad54bQ6PFE3 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rad54bQ6PFE3 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rad54bQ6PFE3 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rad54bQ6PFE3 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rad54bQ6PFE3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rad54bQ6PFE3 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rad54bQ6PFE3 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rad54bQ6PFE3 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rad54bQ6PFE3 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rad54bQ6PFE3 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rad54bQ6PFE3 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rad54bQ6PFE3 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rad54bQ6PFE3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rad54bQ6PFE3 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rad54bQ6PFE3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rad54bQ6PFE3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rad54bQ6PFE3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rad54bQ6PFE3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rad54bQ6PFE3 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rad54bQ6PFE3 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rad54bQ6PFE3 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rad54bQ6PFE3 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rad54bQ6PFE3 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rad54bQ6PFE3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rad54bQ6PFE3 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rad54bQ6PFE3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rad54bQ6PFE3 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms