Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE55

Pdgfrl, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PdgfrlQ6PE55 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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PdgfrlQ6PE55 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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PdgfrlQ6PE55 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PdgfrlQ6PE55 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PdgfrlQ6PE55 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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PdgfrlQ6PE55 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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PdgfrlQ6PE55 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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PdgfrlQ6PE55 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfrlQ6PE55 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfrlQ6PE55 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfrlQ6PE55 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfrlQ6PE55 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfrlQ6PE55 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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