Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PtprnQ60673 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms