Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A4

Trdv2-2, T cell receptor delta variable 2-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv2-2Q5R1A4 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms